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삽교호의 세균 다양성과 계통분류학적 분석
김명, 전은형, 안태영, Kim. Myeong, Jeon. Eun-Hyeong, An. Tae-Yeong 한국미생물학회 미생물학회지 5 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2003, Vol.39 No.4 272-276 (5 pages)
RFLP (restriction fragment length polymorphism)를 분석하였으며, OTUs (operating taxonomy units)로 그룹화하였다. 측정된 종다양성 지수가 8월에 더 높게 나타났으며, 5월의 153개중 34개의 클론과 8월의 131개중 38개의 클론들을 염기서열 분석하였다. 그 결과 Proteobacteria, Cytophaga, Gram positive bacteria와 Verrucomicrobia가 5월과 8월에 공통적으로 분포하는 것으로 나타났으며, 특히 Planctomyces, 시안세균과 엽록체가 조류 대발생이 일어난 8월에 분포하는 것으로 조사되었다. 전반적인 조사결과 삽교호는 전형적인... -
16S rDNA 염기서열에 의한 청정지역 및 공단지역 내 식물잎권의 내산성세균 군집의 다양성
정필문, 신광수, 임종순, 이인수, 박성주 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2001, Vol.37 No.4 265-272 (8 pages)
자라는 떡갈나무(Quercus dentate Thunb.) 잎표면에서 분리한 내산성세균 배양으로부터 16S rDNA를 추출하여 모두 444개의 clone을 얻었으며, 이를 대상으로 Restriction fragment length polymorphism (RFLP)을 실시한 결과 총 17종류의 계통형 (phylotype)이 나타났다. 두 지역에서 나타난 대표적인 내산성 잎권세균 군집은 매우 단순하여 ${gamma}$-Proteobacteria와 low-G+C gram-positive bacteria의 2개 group이었다. 식물 잎의 나이가 들수록 내산성 잎권세균 계통형의 다양성은 현저하게 증가하였다. 내산성 잎권세균 군집 구조는... -
한국산 및 중국산 김치의 Bacteria 군집 분석 및 발효과정 중 Bacilli 포자 형성 규명
안두현, 김혜림, 정도원, 이종훈, An. Doohyun, Kim. Hye-Rim, Jeong. Do-Won, Caldwell. Jane M., Lee. Jong-Hoon 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 10 Pages
한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 2014, Vol.42 No.2 121-130 (10 pages)
가능성의 검토를 위하여 Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) 분석법을 적용하였다. T-RFLP 분석은 김치발효에 관여하는 주요 유산균의 빠르고, 재현성 있는 검출에는 효과적이었지만, 종(species) 수준에서의 미생물 확인에는 한계를 가지고 있어 한국산 및 중국산 김치에 특이적으로 존재하는 bacteria의 검출에는 부적합한 것으로 평가되었다. T-RFLP를 적용한 발효과정 중의 한국산 및 중국산 김치에 존재하는 bacteria 군집 천이 분석은 비슷한 양상으로 나타났고, Bacillus 속이 발효 후기까지 검출되었다.... -
Redundancy Analysis Demonstration of the Relevance of Temperature to Ammonia-Oxidizing Bacterial Community Compositions in a Full-Scale Nitrifying Bioreactor Treating Saline Wastewater
Park. Hee-Deung, Lee. Seung-Yong, Hwang. Seok-Hwan 한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 5 Pages
한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 2009, Vol.19 No.4 346-350 (5 pages)
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AFLP를 이용한 단감나무 탄저병 병원균 Colletotrichum spp.의 유연관계 분석
김희종, 정봉구, 이윤수, Kim. Hee-Jong, Jeong. Bong-Gu, Lee. Youn-Su 한국균학회 한국균학회지 6 Pages
한국균학회 한국균학회지 2001, Vol.29 No.1 9-14 (6 pages)
해결하기 위하여 분자생물학적 방법을 이용하고 있다. 최근에는 RAPD(ramdomly amplified polymorphic DNAs)와 RFLP(restriction fragment length polymorphism)의 장점만을 살린 AFLP(amplified fragment length polymorphism)기법이 유연관계 분석에 있어서 각광을 받고 있고 rDNA부위를 증폭하여 제한효소를 이용하여 다양성을 보는 방법이 많이 이용되고 있다. 이에 본 실험에서는 AFLP 기법 이용하여 단감나무에 탄저병을 일으키는 균들간에 유연관계를 밝혔다. AFLP결과에서 variation이 심하여 각각의 특징적인 band를 검출할 수... -
Pulsed-field Gel Electrophoresis를 이용한 Mycobacterium fortuitum의 유전형 분석
이태윤, 도인아, 김성광, Lee. Tae-Yoon, Do. In-A, Kim. Sung-Kwang 영남의대학술지편집위원회 영남의대 학술지 20 Pages
영남의대학술지편집위원회 영남의대 학술지 1995, Vol.12 No.2 366-385 (20 pages)
Cluster analysis를 시행한 결과 크게 두 집단으로 나뉘었던 M. fortuitum 균주들은 보다 복잡한 집단으로 분류되어 XbaI을 사용한 PFGE분석법이 M. fortuitum 균주분류를 위하여는 보다 적절함을 알 수 있었다. Cluster analysis에서 얻은 최대 % dissimilarity 값은 0.74(AsnI) 및 0.75(XbaI)로서 이 값은 arbitrarily primed polymerase chain reaction(AP-PCR)법보다는 높고 restriction fragment length polymorphism(RFLP) 법보다는 낮아 PFGE법이 RFLP를 보완하거나 대치할 수 있는 세균 유전형 분석법임을 알 수 있었다. -
폐기물매립장 침출수내 미생물군집 구조 해석을 위한 T-RFLP의 활용
유재철, 이태호, Yu. Jae-Cheul, Lee. Tae-Ho 대한환경공학회 대한환경공학회지 10 Pages
대한환경공학회 대한환경공학회지 2010, Vol.32 No.4 369-378 (10 pages)
안정화에는 미생물이 중요한 역할을 수행한다. 폐기물매립장에서 미생물군집 변화 모니터링에 말단 제한절편다형성(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism; T-RFLP)법의 활용 가능성을 평가하고자 박테리아의 16S rDNA 서열에 기초한 T-RFLP법으로 4개의 폐기물매립장 내부에서 채취한 침출수의 미생물군집 구조를 조사하였다. T-RFLP법을 사용하여 해석한 침출수 내 우점 미생물군집 구조와 일반적으로 널리 사용되고 있는 16S rDNA 클론 해석법에 의한 우점 미생물군집구조는 유사하였다. 또한, T-RFLP법을 이용하여...