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Analysis of in planta Expressed Orphan Genes in the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 8 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2014, 30권 4호 4 367-374 (8 pages)
in species-specific adaptive processes. Here, we analyzed seven orphan genes (MoSPC1 to MoSPC7) prioritized based on in planta expressed sequence tag data in the rice blast fungus, Magnaporthe oryzae. Expression analysis using qRT-PCR confirmed the expression of four genes (MoSPC1, MoSPC2, MoSPC3 and MoSPC7) during plant infection. However, individual deletion mutants of these four genes did not differ from the wild-type strain for all phenotypes examined, including pathogenicity. The length, GC... -
배추 뿌리혹병균 Plasmodiophora brassicae의 종 특이적 프라이머 개발
최진수 · 양슬기 · 송정영 · 김홍기* 한국식물병리학회 식물병연구 4 Pages
한국식물병리학회 식물병연구 2014, 20권 1호 4 21-24 (4 pages)
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경기도 김포, 인천 서구지역 소하천의 PCE 탈염소화 군집의 선별 및 다양성 분석
김병혁, 백경화, 조대현, 성열붕, 안치용, 오희목, 고성철, 김희식, Kim. Byung-Hyuk, Baek. Kyung-Hwa, Cho. Dea-Hyun, Sung. Youl-Boong, Ahn. Chi-Yong, Oh. Hee-Mock, Koh. S 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2009, Vol.45 No.2 140-147 (8 pages)
gel electrophoresis (PCR-DGGE) 기법과 탈염소화 미생물을 선택적으로 탐색할 수 있는 species-specific primer를 이용하여 분석하였다. 총 16개의 시료 중에서 접종 8주 만에 3개의 시료에서 ethene까지 탈염소화시켰으며, 4개의 시료에서 cis-1,2-dichloroethene (cis-DCE)까지 탈염소화시켰다. 또한, 16S rRNA gene을 이용한 PCR-DGGE와 탈염소화 species-specific primer를 이용하여 분석한 결과, PCE 탈염소화 시료 내에는 Dehalococcoides sp.와 Geobacter sp.가 주로 존재하였으며, Dehalobacter sp.도 일부 시료에서 검출되었다. -
RecA 유전자 특이적 PCR을 이용한 전통 침채류 유래 유산균의 검출
심상민, 이종훈, Shim. Sang-Min, Lee. Jong-Hoon 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 5 Pages
한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 2008, Vol.36 No.2 96-100 (5 pages)
primer pair을 이용하여 전통 침채류 5증(갓김치, 동치미, 배추김치, 오이소박이, 총각김치로부터 추출한 DNA를 template로 PCR을 수행한 결과, 5종의 침채류 모두에서 Lactobacillus plantarum과 Lactobacillus sakei가 검출되었지만, Lactobacillus paraplantarum, Lactobacillus pentosus와 대조군인 Lb. acidophilus는 검출되지 않았다. Lactobacillus brevis와 Leuconostoc citreum은 배추김치에서만 검출되었으며, Leuconostoc mesenteroides의 경우 갓김치, 동치미, 배추김치, 오이소박이에서 검출되었다. 주재료의 종류에 따라서... -
PCR을 이용한 육류 내 Campylobacter sp. 및 Campylobacter jejuni의 분리 검출
주종원, 홍경포, 김용휘, 조상범, Joo. Jong-Won, Hong. Kyung-Pyo, Kim. Yong-Hui, Cho. Sang-Buem 동아시아식생활학회 東아시아食生活學會誌 7 Pages
동아시아식생활학회 東아시아食生活學會誌 2008, Vol.18 No.5 753-759 (7 pages)
간단한 방법으로 Campylobacter jejuni를 검출하기 위하여 10가지의 Campylobacter genus-specific primer와 C. jejuni species-specific oligonucleotide를 제작하였고, amplification efficiency test를 통하여 4종으로 축소한 후 다시 specificity, sensitivity analysis를 통하여 최종적으로 CB4, CJ1 2종의 oligonucleotide primer를 선별하였다. 선별된 oligonucleotide primer는 각각 Campylobacter genus specific, Campylobacter jejuni에 대한 species specific한 특성을 지닌다. 또한, sensitivity analysis를 통하여 isolated... -
종 특이 프라이머를 이용한 동물성 식품원료의 진위 판별법 개발
김규헌, 이호연, 김용상, 김미라, 정유경, 이재황, 장혜숙, 박용춘, 김상엽, 최장덕, 장영미, Kim. Kyu-Heon, Lee. Ho-Yeon, Kim. Yong-Sang, Kim. Mi-Ra, Jung. Yoo Kyung, Lee. Jae-Hwang, 한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 9 Pages
한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 2014, Vol.29 No.4 347-355 (9 pages)
본 연구에서는 식품 중 동물성 사용원료의 진위 판별을 위하여 분자생물학적 기법을 이용한 시험법을 개발하였다. 동물성 식품원료의 종 판별을 위한 유전자로는 미토콘드리아 DNA에 존재하는 COI, Cytb, 및 16S rRNA 유전자를 대상으로 하였으며, 가공식품에 적용하기 위하여 PCR 산물의 크기는 200 bp 내외가 되도록 종 특이 프라이머를 설계하였다. 대상종으로는 가축류 2종, 가금류 6종, 민물어류 2종, 해양어류 13종 및 갑각류 1종, 총 24종을 선정하였으며 종 특이 프라이머를 이용하여 예상되는 PCR 산물의 생성 유무를... -
PCR을 이용한 식품 중 알레르기 유발물질 검출법 개발
박용춘, 김미라, 신준호, 김규헌, 이재황, 조태용, 이화정, 이상재, 한상배, Park. Yong-Chjun, Kim. Mi-Ra, Shin. Jun-Ho, Kim. Kyu-Heon, Lee. Jae-Hwang, Cho. Tae-Yong, Lee. Hwa 한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 6 Pages
한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 2013, Vol.28 No.2 124-129 (6 pages)
본 연구에서는 분자생물학적 방법을 통한 알레르기 유발 원재료 확인을 위해 PCR방법의 최적 조건을 구축하였다. 가공식품에서 알레르기 원료성분 확인을 위하여 200bp 내외의 PCR 산물을 생성할 수 있는 종특이 프라이머를 설계하거나 선행연구사업 결과를 활용하였다. 대상 원료로는 국내 식품알레르기 표시대상인 난류, 우유, 메밀, 땅콩, 대두, 밀, 고등어, 게, 새우, 돼지고기, 복숭아 및 토마토와 제외국에서 알레르기 유발 성분으로 규정하고있는 아몬드, 참깨를 포함하여 총 14종을 대상으로 하였다. 특이 프라이머를 사용하여... -
식품원료로 사용금지 대상인 기름치 (기름갈치꼬치 및 흑갈치꼬치) 판별법 개발
박용춘, 김미라, 정용현, 신준호, 김규헌, 이재황, 조태용, 이화정, 이상재, 한상배, Park. Yong-Chjun, Kim. Mi-Ra, Jung. Yong-Hyun, Shin. Joon-Ho, Kim. Kyu-Heon, Lee. Jae-Hwang, C 한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 6 Pages
한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 2013, Vol.28 No.1 50-55 (6 pages)
기름치를 참치회 또는 메로구이로 판매하는 사례가 있으며 국내에서는 2012년 6월1일부터 식품원료로 판매가 금지되어 이를 판별하는 시험법 마련이 필요하다. 기름치는 농어목(Perciformes) 갈치꼬치과(Gempylidae)에 속하는 기름갈치꼬치(R. pretiosus)와 흑갈치꼬치(L. flavobrunneum)가 있으며 이를 판별하기 위한 종 특이 프라이머를 개발하기 위하여 미토콘드리아에 존재하는 16S DNA 유전자부위를 선정하였다. 그리고 미국 국립보건원에서 운영하는 유전자 은행(www.ncbi.nlm.nih.gov)에 등록되어있는 기름갈치꼬치, 흑갈치꼬치.... -
식육추출가공품의 사용원료 확인을 위한 유전자추출 방법의 비교 및 검토
박용춘, 김미라, 임지영, 박영은, 신준호, 황초롱, 임잔디, 김규헌, 이재황, 조태용, 이화정, 한상배, Park. Yong-Chjun, Kim. Mi-Ra, Lim. Ji-Young, Park. Young-Eun, Shin. Jun-Ho, Hwang. Ch 한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 6 Pages
한국식품위생안전성학회 한국식품위생안전성학회지 2012, Vol.27 No.2 146-151 (6 pages)
본 연구에서는 분자생물학적 방법을 통한 식육추출가공품의 사용원료 확인을 위해 효율적인 유전자 추출 방법을 검토하였다. 가공식품의 원료성분 확인을 위하여 종 특이 프라이머를 이용하였으며, 대상 식품원료로는 소, 돼지, 닭을 주원료로 가공된 식육추출가공품 13종을 선정하였다. 선정된 시료는 제품유형에 따라 액상, 소스, 분말류로 구분하고 원심분리 등의 전처리를 추가하거나 추출유전자의 증폭을 위하여 Whole Genome Amplification (WGA)를 실시한 뒤 유전자증폭 후 전기영동하여 예상되는 PCR 산물의 생성유무를...
