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Suppression subtractive hybridization (SSH) for isolation and characterization of genes related to testicular development in the giant tiger shrimp Penaeus monodon
Leelatanawit. Rungnapa, Klinbunga. Sirawut, Aoki. Takashi, Hirono. Ikuo, Valyasevi. Rudd, Menasveta. Piamsak 생화학분자생물학회 BMB reports 7 Pages
생화학분자생물학회 BMB reports 2008, Vol.41 No.11 796-802 (7 pages)
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Identification of Differentially Expressed Genes by Exposure of Methylmercury in Neuroblastoma Cell Line Using Suppression Subtractive Hybridization (SSH)
Kim. Youn-Jung, Ryu. Jae-Chun 대한독성유전단백체학회 Molecular & cellular toxicology 7 Pages
대한독성유전단백체학회 Molecular & cellular toxicology 2006, Vol.2 No.1 60-66 (7 pages)
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Selection of Molecular Biomarkers Relevant to Abnormal Behaviors of Medaka Fish (Oryzias latipes) Caused by Diazinon
고성철, 신성우, 조현덕, 전태수, 김정상, 이성규, Koh. Sung-Cheol, Shin. Sung-Woo, Cho. Hyun-Duk, Chon. Tae-Soo, Kim. Jong-Sang, Lee. Sung-Kyu 환경독성보건학회 환경독성학회지 12 Pages
환경독성보건학회 환경독성학회지 2009, Vol.24 No.4 321-332 (12 pages)
개발하는데 있다. 이를 위해 우선 suppression subtractive hybridization (SSH) 및 DNA microarray 기법을 활용하여 다양한 유전자를 스크리닝하였다. 다이아지논에 노출시킨 송사리에서 발현의 차이가 나는 상향 조절된 유전자 97개 (알려지지 않은 유전자 27개 포함)와 하향 조절된 유전자 99개 (알려지지 않은 유전자 60개 포함)를 동정 하였고 이들 중 이상행동과 관련되는 것으로 보이는 유전자 10개 (상향조절 5개, 하향조절 5개)를 선발하였다. 이들 중에서 primer 제작이 잘된 beta-1, Orla C3-1, parvalbumin 및 apolipoprotein... -
Genes of Wild Rice (Oryza grandiglumis) Induced by Wounding and Yeast Extract
Shin. Sang-Hyun, Im. Hyun-Hee, Lee. Jai-Heon, Kim. Doh-Hoon, Chung. Won-Bok, Kang. Kyung-Ho, Cho. Sung-Ki, Shin. Jeong-Sheop, Chung. You 한국생명과학회 생명과학회지 7 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2004, Vol.14 No.4 650-656 (7 pages)
발현유전자의 클로닝에 효율적인 것으로 알려진 Suppression Subtractive Hybridization (SSH) 방법이 처리 후 24시간 된 식물을 재료로 사용되었다. 그 결과, 776개의 cDNA clones이 확보되었으며, 유전자 발현의 진위여부를 빠르게 스크린하기 위하여 colony array가 수행되었다. 115개의 colony가 positive로 판명되었고, 이들의 평균 insert size는 400 bp에서 700 bp에 이르렀고, 이들에 대한 염기서열 분석이 수행되었다. 염기서열 분석 결과, 68개 clone들이 알려진 기능의 유전자와 homology를 나타냈으며, 이중에서 16개 clone이... -
Laser Capture Microdissection을 이용한 유전자 발현 연구(II) : 원시난포와 1차난포 유전자 발현의 차이에 대한 분석
박창은, 고정재, 이숙환, 차광렬, 김격진, 이경아 한국발생생물학회 발생과 생식 8 Pages
한국발생생물학회 발생과 생식 2002, Vol.6 No.2 89-96 (8 pages)
이 초기 난포발달 과정에 관여하는 유전자를 알아내기 위해 suppression subtractive hybridization(SSH)을 사용하였다. 생후 1일과 5일째의 생쥐 난소로부터 얻은 cDNA로 forward와 reverse subtraction을 수행하여 각각 day1과 day5-subtracted cDNA library를 얻었다. 이를 cloning한 결과, 357개 clone의 염기 서열을 BLAST와 RIKEN을 이용해 분석하여 27개의 clone은 novel gene으로 330개의 clone은 데이터 베이스와 일치함을 알았다. 이 중에 기능이 알려진 유전자는 day1에서는 42종, day5에서는 47종이 각각 차이 나게 발현하고... -
Identification of Differentially Expressed Radiation-induced Genes in Cervix Carcinoma Cells Using Suppression Subtractive Hybridization
김준상, 이영숙, 이증훈, 이웅희, 성은영, 조문준, Kim. Jun-Sang, Lee. Young-Sook, Lee. Jeung Hoon, Lee. Woong-Hee, Seo. Eun Young, Cho. Moon-June 대한방사선종양학회 대한방사선종양학회지 8 Pages
대한방사선종양학회 대한방사선종양학회지 2005, Vol.23 No.1 43-50 (8 pages)
polymeric chain reaction (PCR)원리를 이용한 suppression subtractive hybridization (SSH) 방법으로 방사선조사 시 차등 발현되는 유전자를 동정하고자 하였다. 대상 및 방법 : 자궁경부암세포주인 HeLa세포주에 방사선조사 전과 후 총 RNA와 poly $(A)^+$ mRNA를 분리였다. SSH방법으로 forward 및 reverse-subtracted cDNA libraries를 만들었다. 차등 발현된 유전자를 screening하기 위해 reverse Northern blotting (dot blot analysis)을 이용하여 각각의 library에서 88개의 클론을 선택하였고 Nothern blotting으로 확인 후... -
Identification and Expression Analysis of Genes Induced in Response to Tomato chlorosis virus Infection in Tomato
Mehtap ?ahin-?evik, Emine Dogu? Sivri, Bayram ?evik 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 17 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2019, 35권 3호 7 257-273 (17 pages)
Tomato (Solanum lycopersicum) is one of the most widely grown and economically important vegetable crops in the world. Tomato chlorosis virus (ToCV) is one of the recently emerged viruses of tomato distributed worldwide. ToCV-tomato interaction was investigated at the molecular level for determining changes in the expression of tomato genes in response to ToCV infection in this study. A cDNA library enriched with genes induced in response to ToCV infection were constructed and 240 cDNAs were... -
Differentially Expressed Genes under Cold Acclimation in Physcomitrella patens
Sun. Ming-Ming, Li. Lin-Hui, Xie. Hua, Ma. Rong-Cai, He. Yi-Kun 생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 16 Pages
생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 2007, Vol.40 No.6 986-1001 (16 pages)
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An Acidic PATHOGENESIS-RELATED1 Gene of Oryza grandiglumis is Involved in Disease Resistance Response Against Bacterial Infection
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 7 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2014, 30권 2호 13 208-214 (7 pages)
out a subtractive hybridization coupled with a cDNA macroarray. An acidic PATHOGENESIS-RELATED1 (PR1) gene of the wild rice is highly identical to the acidic PR1 genes of different plant species. The OgPR1a cDNA has an apparent single open reading frame with a predicted molecular mass 40,621 Da and an isoelectic point of 5.14. Both in silico analysis and a transient expression assay in onion epidermal cells revealed that the OgPR1a protein could be localized in intercellular space in plants. The...
