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확장된 다중인자 차원축소 (E-MDR) 알고리즘에 기반한 유전자 상호작용 효과 규명
이제영, 이호근, 이용원, Lee. Jea-Young, Lee. Ho-Guen, Lee. Yong-Won 한국통계학회 응용통계연구 9 Pages
한국통계학회 응용통계연구 2009, Vol.22 No.6 1239-1247 (9 pages)
sequence를 함께 고려하여 한우의 경제형질 연관 후보 DNA marker들이 발견되었다. 한편, 통계모형의 상호작용 효과를 고려할 때, 유전자와 같은 범주형 data에서 범주가 많을 경우 상호작용의 조합이 많아지므로 종종 모수들의 상호작용에 대한 해석과 모형을 결정하는 것이 어려울 수 있다. 그래서 비모수적인 방법으로 다중인자 차원축소방법 (MDR)을 사용해왔으며, 사례_대조 데이터에만 적용가능 MDR방법을 연속형 데이터에도 적용하기 위해 CART알고리즘을 적용한 확장된 다중인자 차원축소방법(E-MDR)이 제안되었다. 본 연구에서는... -
품질 정보와 퍼지 추론 기법을 이용한 DNA 염기 서열 배치 알고리즘
김광백, Kim. Kwang-Baek 한국지능정보시스템학회 한국 지능정보시스템학회논문지 14 Pages
한국지능정보시스템학회 한국 지능정보시스템학회논문지 2007, Vol.13 No.2 55-68 (14 pages)
분자 생물학(computational molecular biology) 분야에서 DNA 염기 서열 배치 알고리즘은 다양한 방법으로 개선되어 왔다. 본 논문에서는 기존의 DNA 염기의 품질 정보(quality information)를 이용한 DNA 염기 서열 배치 방법을 개선하기 위하여 퍼지 논리 시스템(fuzzy logic system)과 DNA 염기 서열 단편의 특징을 적용한 품질 정보와 퍼지 추론 기법을 이용한 DNA 염기 서열 배치 알고리즘을 제안한다. 기존의 알고리즘은 Needleman-Wunsch가 제안한 전역 배치 알고리즘에 각 DNA 염기의 품질 정보를 적용하여 DNA 염기 서열 배치... -
Adiponectin을 암호화하는 돼지 APM1 유전자의 염색체상 위치파악과 돌연변이 탐색
박응우, 김재환, 서보영, 정기철, 유성란, 조인철, 이정규, 오성종, 전진태, 이준헌, Park. E.W., Kim. J.H., Seo. B.Y., Jung. K.C., Yu. S.L., Cho. I.C., Lee. J.G., Oh. S.J., Jeon. J. 한국동물자원과학회 한국동물자원과학회지 10 Pages
한국동물자원과학회 한국동물자원과학회지 2004, Vol.46 No.4 537-546 (10 pages)
된 marker는 SIAT1(LOD score 20.29)로 밝혀졌으며 이미 보고된 지방과 관련된 양적형질 유전자 좌위와 일치하였다. 8개의 다른 품종을 이용한 SSCP 분석으로, 한국재래돼지와 한국야생돼지에서 두 개의 특이한 SSCP 타입이 발견되었으며 sequence 분석결과 두 개의 염기가 치환(T672C and C705G)되어 있음을 알 수 있었다. 이 유전자는 사람, 마우스, 소의 염기서열과 약 79-87%의 상동성을 가지고 있으며 다른 포유동물에서 밝혀진 signal sequence, hypervariable region, collagenous region, globular domain과 유사한 구조로 되어... -
Aminoglycoside Modifying Enzymes (AMEs) occurrence among Isolates of Escherichia coli exhibiting High-Level of Aminoglycoside Resistance Isolated from Korean Cattle Farms
Kuastros Mekonnen Belaynehe, Seung Won Shin, Hong Tae Park, Han Sang Yoo 대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 2 Pages
대한수의학회 대한수의학회 학술대회발표집 추계학술심포지움 197 299-300 (2 pages)
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Innate immune response of bovine mammary epithelial cells to Mycoplasma bovis
Satoshi Gondaira, Hidetoshi Higuchi, Hidetomo Iwano, Koji Nishi, Takanori Nebu, Keiichi Nakajima, Hajime Nagahata 대한수의학회 Journal of Veterinary Science 9 Pages
대한수의학회 Journal of Veterinary Science 2018, 제 19권 제 1호 11 79-87 (9 pages)
Mycoplasma spp. are contagious bacteria, and mycoplasmal mastitis is a serious productivity problem on dairy farms. Bovine mammary epithelial cells (bMECs) have an important role in the elimination of pathogens, but the effect of Mycoplasma bovis on bMECs has not been fully described. To elucidate the immune response against intramammary infection by M. bovis, we undertook microarray analysis to examine and profile mRNA expression in bMECs after stimulation with M. bovis. We also compared the... -
Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry based identification of Edwardsiella ictaluri isolated from Vietnamese striped catfish (Pangasius hypothalamus)
Truong Quynh Nhu, Seong Bin Park, Si Won Kim, Jung Seok Lee, Se Pyeong Im, Jassy Mary S. Lazarte, Jong Pyo Seo, Woo-Jai Lee, Jae 대한수의학회 Journal of Veterinary Science 7 Pages
대한수의학회 Journal of Veterinary Science 2016, 제 17권 제 3호 15 377-383 (7 pages)
Edwardsiella (E.) ictaluri is a major bacterial pathogen that affects commercially farmed striped catfish (Pangasius hypothalamus) in Vietnam. In a previous study, 19 strains of E.ictaluri collected from striped catfish were biochemically identified with an API-20E system. Here, the same 19 strains were used to assess the ability of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS; applied using a MALDI Biotyper) to conduct rapid, easy and accurate...
