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생식생물학에세 프로테오믹스의 응용
김호승, 윤용달, Kim. Ho-Seung, Yoon. Yong-Dal 한국발생생물학회 발생과 생식 9 Pages
한국발생생물학회 발생과 생식 2004, Vol.8 No.1 1-9 (9 pages)
MALDI-TOF또는 protein chip array와 SELDI-TOF에 의한 단백질 분자 구조 분석 기술 및 이들을 지원하는 생물정보학(bioinformatics)의 발전을 이용하여, 생식학 연구에 이용할 수 있는 표적 단백질 발굴 및 정성 정량적 연구에 적절한 이용이 가능할 것이다. 이러한 연구는 생식과정 중 배아 발생 및 조직 기관 발생 중 유전자 발현의 변화, 내분비계 장애물질 등 호르몬 및 독성 물질의 작용 기전, ecotoxicogenomics지표 marker의 변동 분석, 중간대사물질체학(metabolomics)에의 이용 등등의 연구에 필수적인 방법으로 발전할 것이다. -
만들어지는 모든 단백질(proteome)을 의미하기도 하고 좁은 의미에서는 세포내의 어떤 organelle(예: Golgi Complex)에 존재하는 단백질 혹은 어떤 protein complex를 지칭하기도 한다. Proteomics는 어떤 주어진 조건에서 특별한 세포 또는 organelle에서 발현되는 단백질들을 연구하고 이해하는데 강력한 수단이 되고 있다. 이런 proteomics는 genomics, bioinformatics 등과 유기적으로 연결되어 세포의 기능을 입체적으로 이해하는데 도움을 준다. 본고에서는 proteomic analysis 과정을 간단히 살피고 최근 세포 생물학에서...
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생물정보학을 이용한 Zebrafish Microsomal Epoxide Hydrolase 클로닝 및 특성연구
이은열, 김희숙, Lee. Eun-Yeol, Kim. Hee-Sook 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 7 Pages
한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 2006, Vol.34 No.2 129-135 (7 pages)
Zebrafish (Danio rerio)의 microsomal epoxide hydrolase(mEH)로 추정되는 유전자를 클로닝하고 그 특성을 연구하였다. D. rerio의 mEH 추정단백질은 포유동물의 mEH 및 세균의 EH들과 아미노산서열 상동성을 보였으므로 결정분자구조(1qo7 및 1ehy)를 template로 하여 homology modelling을 행하였다. 클로된 단백질은 $Asp^{233}$, $Glu^{413}$ 및 $His^{440}$으로 구성된 catalytic triad와 2개의 tyrosine 잔기 및 oxyanion hole이 보존되어 있었다. 생물정보학적인 분석 및 EH 활성시험은 추정단백질이 D. rerio의 mEH라는 것을... -
Genomic Analysis of Dairy Starter Culture Streptococcus thermophilus MTCC 5461
Prajapati. Jashbhai B., Nathani. Neelam M., Patel. Amrutlal K., Senan. Suja, Joshi. Chaitanya G. 한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 8 Pages
한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 2013, Vol.23 No.4 459-466 (8 pages)
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Algorithm for Predicting Functionally Equivalent Proteins from BLAST and HMMER Searches
Yu. Dong Su, Lee. Dae-Hee, Kim. Seong Keun, Lee. Choong Hoon, Song. Ju Yeon, Kong. Eun Bae, Kim. Jihyun F. 한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 5 Pages
한국미생물생명공학회 Journal of microbiology and biotechnology 2012, Vol.22 No.8 1054-1058 (5 pages)
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생물 정보원에 대한 통합 질의를 지원하는 그래픽 사용자 인터페이스 개발
정채영, 조찬제, 박홍원, 박은경, 김현주, 배종민, Jung. Chai-Young, Cho. Chan-Je, Park. Hong-Won, Park. Eun-Kyung, Kim. Hvun-Ju, Bae. Jong-Min 한국멀티미디어학회 멀티미디어학회논문지 15 Pages
한국멀티미디어학회 멀티미디어학회논문지 2007, Vol.10 No.1 102-116 (15 pages)
XML 기반의 미디에이터 시스템은 분산된 이질의 정보원들을 가상적으로 통합하는 방법 중의 하나이다. 이는 각 정보원을 하나의 가상의 XML 데이터베이스로 간주하고 XML 질의어로써 정보원에 접근한다. 본 논문은 사용자가 각 생물 정보원에 대한 XML 뷰를 융통성 있게 정의하고, 또한 정의한 XML 뷰를 기반으로 통합된 XML 질의를 쉽게 생성할 수 있는 사용자 인터페이스에 대한 설계 개념과 개발 결과를 제시한다. 개발된 인터페이스는 통합 스키마에 대하여 XML 뷰나 XML 질의를 손쉽게 생성할 수 있을 뿐 아니라, 하나 이상의 생물... -
Set Covering 기반의 대용량 오믹스데이터 특징변수 추출기법
마정우, 안기동, 김광수, 류홍서, Ma. Zhengyu, Yan. Kedong, Kim. Kwangsoo, Ryoo. Hong Seo 한국경영과학회 韓國經營科學會誌 10 Pages
한국경영과학회 韓國經營科學會誌 2014, Vol.39 No.4 75-84 (10 pages)