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Sphingomonas chungbukensis DJ77의 Glucosyl-Isoprenyl Phosphate-Transferase를 암호화할 것으로 추정되는 spsB 유런자
이수연, 최정도, 신말식, 김영창, Lee. Soo-Youn, Choi. Jung-Do, Shin. Malshick, Kim. Young-Chang 한국미생물학회 미생물학회지 5 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.1 8-12 (5 pages)
S. chungbukensis DJ77의 genome project수행 결과 다당류 생 합성 에 관련된 유전자들의 염기서열을 찾아내었다. 본 논문에서는 이러한 유전자들 중 sphigan형 다당류 생합성에 관여하는 glucosyl-isoprenyl phosphate-transferase를 암호화 하는 유전자의 완전한 서열을 결정하였고, spsB로 명명하였다. 이 유전자는 ATG를 개시코돈으로 사용하며, TGA를 종결코돈으로 사용하고 있다. 또한 총 1392 bp의 open reading frame을 포함하며, 463개의 아미노산으로 구성되어있다. SpsB를 구성하는 아미노산 서열은 동일한 속의 sphingan 형성... -
Sphingomonas chungbukensis DJ77에서 Sphingosine Kinase를 암호화하는 spk 유전자의 동정과 대장균에서의 발현
이수리, 엄현주, 김영창, Lee. Su-Ri, Um. Hyun-Ju, Kim. Young-Chang 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.2 93-98 (6 pages)
Sphingomonas chungbukensis DJ77의 유전체 서열분식 과정에서 969개의 nucleotide로 구성된 sphingosine kinase 유전자를 동정하였다. 이 sphingosine kinase 단백질의 아미노산 서열은 Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4의 sphingosine kinase 아미노산 서열과 $55\%$의 상동성을 보였다. 또한 다중서열정렬을 통해 각각 진핵세포의 sphingosine kinase의 C2, C3, C5 domain에 속하는 3개의 conserved sequence를 발견하였다. 그 중 하나는 sphingosine kinase에서 ATP-binding site일 것으로 예상되어지는nucleotide-binding... -
Sphingomonas chungbukensis DJ77 균주에서 2- hydroxychromene-2-carboxylate isomerase를 암호화하는 phnS 유전자의 염기서열과 상동성 분석
엄현주, 강민희, 김영필, 김성재, 김영창 한국미생물학회 미생물학회지 5 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2003, Vol.39 No.3 123-127 (5 pages)
Sphingomonas chungbuken교 DJ77은 phenanthrene을 단일 탄소원과 에너지원으로 이용하여 살아갈 수 있다. pUPXS는 phenanthrene과 naphthalene분해를 위해 필요한 2-hydroxychromene-2-carboxylate (HCCA) isomerase를 암호화하는phnS유전자를 포함한다. 본 논문에서는 phnS유전자가 포함된 3271 bp의 염기 서열을 결정하였다. 이 유전자는 ATG를 개시코돈으로 사용하며, TAA를 종결 코돈으로 사용하고 있다. 또한 개시 코돈의 5 bp앞쪽으로 GGAA라는 ribosomal binding site를 갖는다. phnS는 총 594 bP의 open reading frame을... -
Sphingomonas chungbukensis DJ77에 존재하는 Plasmid pSY1의 PAH 분해능
박승기, 김성재, 신희정, 김영창 한국미생물학회 미생물학회지 4 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2001, Vol.37 No.2 120-123 (4 pages)
Sphingomonas chungbukensis DJ77에서 난분해성 물질 분해 유전자가 chromosome 또는 plasmid 존재하는지를 규명하였다. 야생주 DJ77의 plasmid를 mitomycin C를 이용하여 curing 시킨 후, 각각 phenanthrene과 biphenyl이 단일 탄소원으로 첨가된 최소배지에서 배양한 결과 야생주는 성장을 하지만 plasmid가 제거된 DJ77은 성장하지 않았다. 각각의 plasmid DNA를 분리한 수 이미 클로닝된 방향족 탄화수소 분해에 관련된 DNA를 probe로 하여 Southern hybridization을 한 결과 야생주에서만 positive signal을 발견할 수 있었다. -
Sphingomonas chungbukensis DJ77 균주에서 Phosphomannomutase를 암호화하는 pmmC 유전자의 클로닝과 발현
김미혜, 최정도, 신말식, 김영창, Kim. Mi-Hye, Choi. Jung-Do, Shin. Malshick, Kim. Young-Chang 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 6 Pages
한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 2005, Vol.33 No.2 84-89 (6 pages)
본 논문에서는 Sphingomonas chungbukensis DJ77에서 phosphomannomutase를 암호화하는 유전자를 유전체 library로부터 동정하고 이를 pmmC로 명명하였으며, 이를 발현 vector에 클로닝하고 염기서열을 분석하였다. 유전자 pmmC는 ATG를 개시 코돈으로 사용하고, TAG를 종결 코돈으로 사용하는 750 bp의 open reading frame임을 확인하였고, 이 ORF의 5 bp앞쪽으로 리보좀 결합 부위가 존재한다. 이 ORF로부터 유추되는 아미노산은 249개이며, 단백질 분자량은 약 27.4 kDa이다. 이 유전자를 구성하는 아미노산 서열은 NCBI의 conserved... -
Cloning, Expression, and Characterization of UDP-glucose Pyrophosphorylase from Sphingomonas chungbukensis DJ77
Yoon. Moon-Young, Lee. Kyoung-Jin, Park. Hea-Chul, Park. Sung-Ha, Kim. Sang-Gon, Kim. Sung-Kun, Choi. Jung-Do 대한화학회 Bulletin of the Korean Chemical Society 5 Pages
대한화학회 Bulletin of the Korean Chemical Society 2009, Vol.30 No.6 1360-1364 (5 pages)
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Cloning and Characterization of UDP-glucose Dehydrogenase from Sphingomonas chungbukensis DJ77
Yoon. Moon-Young, Park. Hye-Yeon, Park. Hae-Chul, Park. Sung-Ha, Kim. Sung-Kun, Kim. Young-Chang, Shin. Mal-shik, Choi. Jung-Do 대한화학회 Bulletin of the Korean Chemical Society 6 Pages
대한화학회 Bulletin of the Korean Chemical Society 2009, Vol.30 No.7 1547-1552 (6 pages)