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C형 간염바이러스(HCV)의 NS5B RNA Replicase에 의해 활성이 유도되는 Hammerhead 리보자임에 의한 HCV 복제 억제 연구
이창호, 이성욱, Lee. Chang-Ho, Lee. Seong-Wook 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2011, Vol.47 No.3 188-193 (6 pages)
수 있는 HCV internal ribosome entry site (IRES) 표적 hammerhead 리보자임을 개발하였다. 이러한 리보자임은 HCV IRES 염기서열 중 +382 nucleotide 자리를 인지하는 hammerhead 리보자임, NS5B RNA replicase와 특이적으로 결합하는 RNA aptamer 부위, 그리고 aptamer와 NS5B와의 결합에 의해 리보자임 활성을 유도할 수 있도록 구조적 변이를 전달할 수 있는 communication module 부위 등으로 구성되어 있다. 이러한 allosteric 리보자임에 의해 세포 배양에서 HCV의 replicon 복제가 효과적으로 억제됨을 실시간 PCR 분석을 통하여... -
C형 간염바이러스(HCV)의 NS5B RNA Replicase에 의해 그 활성이 조절되는 HCV지놈 표적 Hammerhead 리보자임 개발
이창호, 이성욱, Lee. Chang-Ho, Lee. Seong-Wook 한국미생물학회 미생물학회지 7 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2007, Vol.43 No.3 159-165 (7 pages)
이 조절될 수 있는 HCV internal ribosome entry site (IRES) 표적 hammerhead 리보자임을 개발하였다. 우선 HCV IRES 염기서열 중+382 nucleotide(nt) 부위가 리보자임에 의해 가장 잘 인식되었음을 관찰하였다. 이러한 allosteric 리보자임은 NS5B RNA replicase와 특이적으로 결합하는 RNA aptamer 부위, aptamer와 NS5B와의 결합에 의해 리보자임 활성을 유도할 수 있도록 구조적 변이를 전달할 수 있는 communication module부위 및 HCV IRES의 +382 nt를 인지하는 hammerhead 리보자임 등으로 구성되도록 설계하였다. 특히 in vitro... -
In Vitro Selection of Hammerhead Ribozymes with Optimized Stems I and III
Sim. So-Yeong, Kim. Se-Mi, Kim. Ha-Dong, Ahn. Jeong-Keun, Lee. Young-Hoon, Cho. Bong-Rae, Park. In-Won 생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 6 Pages
생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 1998, Vol.31 No.2 177-182 (6 pages)
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Construction of Infectious cDNA Clone of a Chrysanthemum stunt viroid Korean Isolate
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 7 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2014, 30권 1호 8 68-74 (7 pages)
Chrysanthemum stunt viroid (CSVd), a noncoding infectious RNA molecule, causes seriously economic losses of chrysanthemum for 3 or 4 years after its first infection. Monomeric cDNA clones of CSVd isolate SK1 (CSVd-SK1) were constructed in the plasmids pGEM-T easy vector and pUC19 vector. Linear positive-sense transcripts synthesized in vitro from the full-length monomeric cDNA clones of CSVd-SK1 could infect systemically tomato seedlings and chrysanthemum plants, suggesting that the linear CSVd... -
시험관내에서 합성한 오이모자이크 바이러스 RNA단편을 성공적으로 절단한 ribozyme의 식물체내의 발현
박상규, Park. Sang-Gyu 한국응용생명화학회 한국농화학회지 6 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1996, Vol.39 No.5 355-360 (6 pages)
시험관내에서 합성한 오이모자이크 바이러스 RNA단편을 성공적으로 절단한 ribozyme (한국농화학회지 37: 56-63(1994))을 담배 식물체에 발현시켜 바이러스 저항성 식물체를 만들려고 하였다. 해당 ribozyme의 염기서열을 함유한 DNA 단편을 꽃양배추 바이러스 35S promoter와 nopaline 합성효소 terminator에 연결시키고 연결 부위 및 ribozyme의 염기서열을 확인하였다. 염기서열을 확인한 합성유전자를 Agrobacterium tumefaciens LBA4404에 합성유전자를 함유한 E. coli HB101을 E. coli HB101(pRK2073)를 helper로 Agrobacterium... -
흑조위축병 바이러스 RNA를 절단하는 망치머리형 라이보자임의 제작
김주곤, 손성한, 이석순, 황영수, 박종석, Kim. Ju-Kon, Sohn. Seong-Han, Lee. Sug-Soon, Hwang. Young-Soo, Park. Jong-Sug 한국응용생명화학회 한국농화학회지 6 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1995, Vol.38 No.6 522-527 (6 pages)
흑조위축병 바이러스(RBSDV)에 대한 antiviral agent를 개발하기위하여 RBSDV 게놈 조각 3번을 절단하는 망치머리형 구조의 라이보자임을 설계하였다. 라이보자임과 기질의 oligonucleotides는 DNA 합성기로 합성 후 서로 합치고, pBluescript KS(+)에 삽입하였다. 라이보자임과 기질 RNA는 $T_3$ RNA polymerase로 기내 전사하여 각각 193과 183 nucleotide의 RNA를 얻었다. 기질 RNA는 라이보자임 RNA에 의해 $55^{circ}C$에서 2개의 조각으로 절단되었으나 $37^{circ}C$에서는 절단되지 않았다. 또한 RBSDV의 3번 조각 RNA도 동일한... -
인공적으로 합성한 오이모자이크 바이러스 RNA의 헤머헤드 ribozyme에 의한 시험관내에서의 절단
박상규, 황영수, Park. Sang-Gyu, Hwang. Young-Soo 한국응용생명화학회 한국농화학회지 8 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1994, Vol.37 No.1 56-63 (8 pages)
CMV RNA에 대항한 헤머헤드(hammerhead) 구조의 ribozyme을 만드는 올리고뉴클 레오타이드(oligonucleotide, nt)를 DNA 합성기를 이용하여 제조하였다. 올리고뉴클레오타이드의 양쪽가닥을 서로 합친 후 제한효소 BamHl과 SacI으로 처리하여 플라스미드 pBS SK(+)에 삽입하였고 CMV 기질과 ribozyme 클론의 염기서열을 결정하여 확인하였다. 기질과 ribozyme 클론 $1;{mu}g$ BssHII이나 SspI으로 처리한후 T7 RNA 합성효소를 이용하여 튜브내에서 전사반응을 실시하였다. 제한효소 BssHII를 처리한 경우 만들어진 기질 RNA의 크기는 176... -
In vitro Synthesis of Ribonucleic Acids by T7 RNA Polymerase That was Fast Purified with a Modified Procedure
김기선, 최우형, 공수정, 전숭종, 김재현, 오상택, 김동은, Kim. Ki-Sun, Choi. Woo-Hyung, Gong. Soo-Jung, Jeon. Sung-Jong, Kim. Jae Hyun, Oh. Sangtaek, Kim. Dong-Eun 한국생명과학회 생명과학회지 8 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2005, Vol.15 No.5 755-762 (8 pages)
세포 내에서 매우 적은 양으로 존재하는 RNA 전사체와 기능적으로 동일하거나 비슷한 RNA를 RNA 중합효소를 써서 in vitro에서 생화학적으로 의미 있는 양 만큼을 합성할 수 있다. T7 RNA중합효소를 발현하는 재조합 유전자를 지닌 대장균주 BL21/pAR1219로부터 순수한 T7 RNA중합효소를 손쉽게 얻는 방법을 본 논문에서 소개한다. 황산암모늄 분획화와 sephadex SP 컬럼 크로마토그래피법으로써 여타의 방법과 비교하여 더 간단하고 빠르게, 그리고 경제적으로 T7 RNA 중합효소를 분리할 수 있었다. 정제된 T7 RNA중합효소를 이용하여... -
MAXIZYMEs: Allosterically controllable ribozymes with biosensor functions
Kurata. Hiroyuki, Miyagishi. Makoto, Kuwabara. Tomoko, Warashina. Masaki, Taira. Kazunari 생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 7 Pages
생화학분자생물학회 Journal of biochemistry and molecular biology 2000, Vol.33 No.5 359-365 (7 pages)
