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엽록체 DNA 염기서열 분석을 이용한 한국산 초롱꽃과 (Campanulaceae)의 계통유연관계
김경아, 유기억, Kim. Kyung-Ah, Yoo. Ki-Oug 한국식물분류학회 식물분류학회지 12 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2012, Vol.42 No.4 282-293 (12 pages)
30분류군에 대한 계통유연관계를 알아보기 위하여 엽록체 DNA의 atpB, atpB-rbcL, atpF-H, matK, rbcL, rpl16, rpoC1 그리고 trnL-F 지역의 염기서열 분석을 실시하였다. 8개 유전자 지역의 염기서열 자료를 융합하여 분석한 결과 도라지속과 더덕속이 가장 기부에 분계조를 형성하였고 애기도라지속과 초롱꽃속은 각각 독립적으로 유집되었다. 홍노도라지속과 영아자속은 잔대속-금강초롱꽃속 분계조를 위한 자매군을 형성하였으며, 금강초롱꽃속은 잔대속의 모시대절과 분계조를 형성하였고 잔대속은 크게 하나의 군을 형성하였다. 본... -
엽록체 DNA 염기서열에 근거한 물여뀌 종집단(마디풀과)의 분류학적 연구
박진희, 박종욱, Park. Jin Hee, Park. Chong-Wook 한국식물분류학회 식물분류학회지 12 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2013, Vol.43 No.1 34-45 (12 pages)
서로 구분되는 것으로 나타났다. 그러나, 동일 개체군 또는 동일 지역내에서 채집된 수생형과 육생형 개체들은 엽록체 DNA 4개 구간(matK, psbA-trnH IGS, rbcL-accD IGS, trnL-trnF)에서 완전히 동일한 염기서열을 공유하는 것으로 밝혀져 유전적으로는 분기되지 않은 것으로 추정되며, 따라서 본 종집단에서 나타나는 생육형간의 형태적 차이는 서식지 환경에 따른 개체 변이인 것으로 판단된다. 형태분석 및 엽록체 4구간 염기서열 유합자료의 계통분석 결과, 한국, 일본, 중국, 몽골, 극동 러시아 지역 등에 분포하는 아시아산 개체... -
한국산 둥굴레속 식물의 형태적 특성 및 엽록체 DNA 염기서열을 이용한 유연관계 분석
김정훈, 서재완, 변지희, 안영섭, 차선우, 조준형, Kim. Jeong Hun, Seo. Jae Wan, Byeon. Ji Hui, Ahn. Young Sup, Cha. Seon Woo, Cho. Joon Hyeong 한국약용작물학회 韓國藥用作物學會誌 8 Pages
한국약용작물학회 韓國藥用作物學會誌 2014, Vol.22 No.6 489-496 (8 pages)
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엽록체 DNA 염기서열을 이용한 한약재 지모의 기원 확인 및 유연관계 분석
김명겸, 베갈마, 손화, 노종훈, 김세영, 양덕춘, Kim. Myung-Kyum, Jigden. Baigalmaa, Sun. Hua, Noh. Jong-Hun, Kim. Se-Young, Yang. Deok-Chun 한국약용작물학회 韓國藥用作物學會誌 7 Pages
한국약용작물학회 韓國藥用作物學會誌 2008, Vol.16 No.1 20-26 (7 pages)
지모로 확인된 3종의 식물체를 수집하여 엽록체 DNA의 trnL-F 염기서열을 분석하였다. 분석 결과, 국내 연구기관에서 보관중인 지모 식물체들이 모두 동일한 trnL-F의 염기서열을 보여서, 형태학적 분류와 계통유전학적 분류가 동일함을 확인하였다. 최초로 얻어진 지모 trnL-F 염기서열은 NCBI database에 등록하였다. 다음으로 국내 한약재 시장과 중국 한약재 시장에서 유통 중인 지모 한약재를 다량 구입하여 trnL-F의 염기서열을 분석하였다. 그 결과, 유통 중인 지모 한약재들이 모두 기원식물과 동일한 TrnL-F의 염기서열을 보여서... -
엽록체 DNA psbA-trnH와 atpF-H 염기서열에 기초한 한국산 소나무속의 분자계통학적 연구
홍정기, 양종철, 이유미, 김주환, Hong. Jeong-Ki, Yang. Jong-Cheol, Lee. You-Mi, Kim. Joo-Hwan 한국식물분류학회 식물분류학회지 8 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2014, Vol.44 No.2 111-118 (8 pages)
엽록체 DNA atpF-H, psbA-trnH region을 마커로 활용하여 국내에 분포하는 소나무속 식물들 중 17분류군에 대한 분자계통학적 연구를 수행하여 한국산 소나무속의 계통학적 유연관계를 규명하고, 소나무속의 유연관계를 잘 나타낼 수 있는 분자마커를 찾아내고자 연구가 수행되었다. atpF-H, psbA-trnH region의 조합분석결과 한국산 소나무속은 100%의 BP로 지지되는 단계통군으로 확인되었으며, 소나무아속과 잣나무아속으로 명확히 구분되어졌다. 본 연구에서 이용된 두 개의 분자마커 중 psbA-trnH region이 atpF-H region보다 한국산... -
엽록체 DNA matK와 psbA-trnH 염기서열에 기초한 한국산 향나무절(향나무속) 식물의 분자계통학적 연구
홍정기, 양종철, 오승환, 이유미, Hong. Jeong-Ki, Yang. Jong-Cheol, Oh. Seung-Hwan, Lee. You-Mi 한국식물분류학회 식물분류학회지 8 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2014, Vol.44 No.1 51-58 (8 pages)
있는 분자마커를 찾아내고자 분자계통학적 연구를 수행하였다. 엽록체 DNA matK와 psbA-trnH를 분자마커로 활용하였으며, 두 유전자의 조합분석결과 향나무절이 100%의 BP로 지지되는 분계조를 이루었다. 눈향나무+단천향나무 분계조와 향나무+섬향나무+뚝향나무 분계조는 각각 91%, 100%의 BP로 지지되었다. 따라서 한국산 향나무절은 (1) 눈향나무+단천향나무, (2) 향나무+섬향나무+뚝향나무 두 개의 분계조로 구분하는 것이 가장 적합할 것으로 생각되고, 본 연구에서 이용된 두 개의 분자마커 중 matK가 psbA-trnH 보다 향나무속 및... -
엽록체 DNA trnL-F 및 핵리보조옴 DNA ITS, ETS 염기서열에 의한 고려인삼의 유전적 변이와 계통학적 유연관계
방찬국, 김주환, 백명현, 김창식, 엄동명, 김동희, Bang. Chan Kuk, Kim. Ju Hwan, Baek. Myeong Hyun, Kim. Chang Sik, Um. Dong Myeong, Kim. Dong Hee 대한동의생리학회 동의생리병리학회지 11 Pages
대한동의생리학회 동의생리병리학회지 2004, Vol.18 No.6 1699-1709 (11 pages)
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벼 엽록체 DNA내의 151 bp 반복염기서열에 의한 유전자 재배열
남백희, 김한집, Nahm. Baek-Hie, Kim. Han-Jip 한국응용생명화학회 한국농화학회지 7 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1993, Vol.36 No.3 208-214 (7 pages)
따라 분리하고, rp12 probe를 이용하여 Southern blot 분석하여 엽록체의 발달에 따르는 엽록체 DNA의 재배열 현상을 관찰하였다. 아울러 유전자 재배열 현상을 유발하는 반복염기서열을 database로부터 검색하여 유전자의 상호 비교 분석하였다. 그 결과 151bp Repeated Sequence와 유사한 염기 서열을 같는 rp123유전자를 포함하는 이질적인 유전인자군은 어느 특정한 품종의 벼에 국한되는것이 아니고 본 실험에 사용된 다양한 품종의 벼에 일반적으로 나타나는 현상임이 확인되었으며 또한 이들의 양상은 벼의 조직 부위에 따라... -
엽록체 DNA를 이용한 섬괴불나무(Lonicera insularis Nakai)의 종내변이 및 지리학적 연구
정금선, 김미선, 이웅, 박재홍, Jeong. Keum Seon, Kim. Mi Sun, Lee. Woong, Pak. Jae-Hong 한국식물분류학회 식물분류학회지 6 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2014, Vol.44 No.3 202-207 (6 pages)
종내 변이를 확인하기 위해 엽록체 DNA 5개 영역의 염기서열을 분석하였다. 분석결과 전체 3.2kb의 염기서열이 결정되었고, 섬괴불나무와 L. morrowii 에서 2개의 엽록체 DNA haplotype(CP01-02)이 결정되었다. 섬괴불나무는 한 개의 염기치환으로 CP01 type과 CP02 type으로 구별되었으며, 일본의 L. morrowii와는 CP02 type을 공유하였다. 섬괴불나무에서 확인 된 두 개의 CP type은 1) 진화적으로 뚜렷한 두 개 이상의 계통을 가지며, 이는 하나 이상의 유입경로를 통해 울릉도로 유입되었을 가능성을 높게 지지한다. 그리고, 2)... -
Identification of host plant species of Balanophora fungosa var. indica from Phnom Bokor National Park of Cambodia using DNA barcoding technique
김주환, 원효식, Kim. Joo Hwan, Won. Hyosig 한국식물분류학회 식물분류학회지 11 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2013, Vol.43 No.4 252-262 (11 pages)
숙주를 확인하기 위해 숙주의 뿌리와 더불어 주변에 위치한 목본 식물을 채집하였으며, 이들을 DNA barcoding 방법을 사용하여 동정하였다. DNA barcode 마커로는 엽록체 rbcL 및 matK 유전자 구간을 적용하였으며, 15개의 숙주 뿌리와 7개의 주변 목본식물로부터 성공적으로 PCR 증폭 및 염기서열을 확보하였다. 숙주 뿌리로부터 얻어진 숙주의 염기서열은 앵초과, 노박덩굴과, 도금양과, 그리고 물푸레나무과로 식별되었으며, 주변의 목본식물은 물푸레나무과, 도금양과, 무환자나무과, 장미과, 물레나물과, 철쭉과와 녹나무과였다. 속... -
PCR-aided RFLP기술을 이용한 인삼의 DNA분석
양덕춘, 김무성, Yang. Deok-Chun, Kim. Moo-Sung 고려인삼학회 Journal of ginseng research 5 Pages
고려인삼학회 Journal of ginseng research 2003, Vol.27 No.3 146-150 (5 pages)
밴드를 형성하였으나 제한효소 처리후 각 인삼 종내 또는 종간 식별이 용이하지 않아서 좀 더 많은 제한효소를 사용하거나 증폭된 DNA를 염기서열을 분석하여 비교하는 방법이 고려 되어야 할 것으로 사료된다. 3.75~9.71 ppm이었다. Brgkafid에 있어서는 일본홍삼이 2.10~3.56 ppm으로 나타났으나 한국홍삼은 0.89~2.77 ppm, 중국홍삼은 0.42~1.04 ppm이었고 Ce함량은 일본홍삼이 가장 낮았다.는 것을 시사하여 주었다. 이로 미루어, 산소유리라디칼에 의한 뇌조직 $Na^+-K^+-ATPase$의 불활성화는 뇌 허혈병소에서 관찰되는 신경세로의... -
방사선조사 유래의 조기출수 식물(Oryza sativa L.) 계통의 유전적 변이 분석
류재혁, 소현수, 류재일, 권오도, 이영일, 진일두, 이효연, 배창휴, Ryu. Jai-Hyunk, So. Hyun-Su, Lyu. Jae-Il, Kwon. Oh-Do, Lee. Young-Il, Jin. Il-Doo, Lee. Hyo-Yeon, Bae. 한국자원식물학회 韓國資源植物學會誌 10 Pages
한국자원식물학회 韓國資源植物學會誌 2012, Vol.25 No.1 142-151 (10 pages)
5일(${gamma}$-3 계통), 4일(${gamma}$-4 계통)이 빠르게 나타났다. ISSR 분석 결과, 선발계통의 유전적 다형성은 ${gamma}$-2 계통 5.9%, ${gamma}$-1 계통 7.5%, ${gamma}$-4 계통 15.1%, ${gamma}$-3 계통 15.3%, X-1 계통 19.4%, ${gamma}$-5 계통 23.4%로 대조품종의 4.3% 보다 높게 나타나 방사선 조사로 DNA 수준에서 변이가 증가되었음을 확인하였다. 엽록체 DNA(rps16-trnK 영역) 분석 결과, 염기 길이는 대조 품종과 같은 664 bp인 반면, 총 5개 염기서열 영역에서 치환 변이가 발생하였고 그 중 6 bp 및 587 bp 영역의 변이는... -
Phylogenetic implication of seed coat sculpturing in subtribe Agrimoniinae (Rosaceae)
정경숙, 오병운, Chung. Kyong-Sook, Hoang. Nguyet, Elisens. Wayne, Oh. Byoung Un 한국식물분류학회 식물분류학회지 6 Pages
한국식물분류학회 식물분류학회지 2012, Vol.42 No.4 247-252 (6 pages)
6개의 엽록체 DNA의 염기서열에 기초한 계통수에서는 적어도 2회의 형질변화가 요구되며, 저복사수 핵 유전자의 염기서열 계통분석의 계통수에서는 단 1회의 형질변화가 일어나는 것으로 나타났다. 종합하면, 종피의 유두상 돌기의 출현은 Agrimonia(짚신나물속)과 Aremonia 을 단일계통 분류군으로 설명하는 공통진화형질이라고 할 수 있고 이러한 가설은 저복사수 유전자의 염기서열의 계통분석을 지지하고 있다. 이렇게 종피 형질은 장미과 Agrimoniinae(짚신나물아족)의 속간의 계통분류학적 이해에 매우 유용한 형질임을 밝힌다. -
현삼과에서 재분류된 식물들의 계통분류학적 고찰
배영민, Bae. Young-Min 한국생명과학회 생명과학회지 6 Pages
한국생명과학회 생명과학회지 2011, Vol.21 No.2 273-278 (6 pages)
꿀풀목 현삼과에 속하는 식물들의 재분류가 최근에 이루어졌는데, 엽록체 DNA의 염기서열에 따라 많은 수의 식물들이 꿀풀목의 다른 과로 옮겨졌다. 이들 중에서 국내의 산야에서 쉽게 발견할 수 있는 꽃며느리밥풀, 나도송이풀, 물칭개나물, 외풀, 주름잎의 계통분류를 시도해 보았다. 우선, 이 식물들의 18S rRNA 및 ITS1의 염기서열을 결정하여 GenBank에 등록하였다(각각, accession numbers GU359046, GU359047, GU359048, GU359049, GU359050). 꽃며느리밥풀, 나도송이풀 및 물칭개나물의 경우에는 엽록체 DNA의 염기서열에 기초를... -
삽교호의 세균 다양성과 계통분류학적 분석
김명, 전은형, 안태영, Kim. Myeong, Jeon. Eun-Hyeong, An. Tae-Yeong 한국미생물학회 미생물학회지 5 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2003, Vol.39 No.4 272-276 (5 pages)
변화를 분자생태학적 접근 방법을 통해 조사하였다. 시료 채취는 5월과 8월 삽교호 방조제 앞 표층수에서 실시하였으며, 분자생태학적 접근을 위해 시료로부터 DNA를 직접 추출하고, 16S rDNA를 증폭한 후 pGEM-T easy vector에 삽입하여 클로닝을 수행하였다. 획득한 클론 라이브러리를 이용하여 RFLP (restriction fragment length polymorphism)를 분석하였으며, OTUs (operating taxonomy units)로 그룹화하였다. 측정된 종다양성 지수가 8월에 더 높게 나타났으며, 5월의 153개중 34개의 클론과 8월의 131개중 38개의 클론들을...