RAPD 분석법에 의한 한국형 대장균파아지와 미국형 대장균파아지의 분자적 계통분류

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기타언어초록

분리한 한국형 대장균파아지군($phi$C1, $phi$C2, $phi$C3 및 $phi$C4)과 잘 알려진 미국형 대장균파아지군($phi$T2, $phi$T4, $phi$T5, $phi$T7 및 ${phi}{lambda}$)의 유전적 유연관계를 조사하기 위하여 분자적 계통분류를 위한 방법인 RAPD-PCR을 실시하고 컴퓨터분석을 하였다. 그 결과, 9개의 대장균파아지들은 5개의 그룹으로 나위어지면서 한국형 대장균파아지들만이 그들간의 유전적 유사도가 매우 높으면서 하나의 클러스터를 형성하였다. 반면 이국형 대장균파아지들은 오직 하나의 서브클러스터를 가지며 나누어졌다. 즉, 미국형 대장균파아지 중 $phi$T2와 $phi$T4($T_{even}$ 파아지)만이 하나의 서브클러스터를 형성하면서 $phi$T5, $phi$T7 및 ${phi}{lambda}$들과 뚜렷히 구분되고 있었다. 그리고 한국형 대장균파아지들은 미국형 대장균차이지 중 오직 ${phi}{lambda}$와 유전적 유연관계를 갖고 있음을 확인하였다. 한편 한국형 대장균파아지의 게놈의 크기는 25,000 bp~35,000 bp 정도 였으며, 이 중 $phi$C2가 그 크기가 가장 작고 $phi$C1이 가장 컸다. 그리고 $phi$C3과 $phi$C4의 게놈은 중간 크기로 비슷하였다.

기타언어초록

RAPD-PCR was applied to identify the phylogenetic relationship between isolated Korean-type coliphages ($phi$C1, $phi$C2, $phi$C3 and $phi$C4) and well-known American coliphages ($phi$T2, $phi$T4, $phi$T5, $phi$T7 and ${phi}{lambda}$). Subsequently, a computer analysis was carried out with the results of RAPD-PCR. As a result, 9 individuals were divided into five groups. The Korean-type coliphages formed a single cluster which showed very high genetic similarity but the American-type coliphages revealed very low genetic similarity among them. In particular, the $phi$T2와 $phi$T4 (T$_{even}$ phages) made one sub-cluster among American coliphages, and they were very distant from $phi$T5, $phi$T7 and ${phi}{lambda}$. However, ${phi}{lambda}$ made a cluster with the Korean-type coliphages that we isolated. The genome size of Korean-type coliphages was ranged from 25,000 bp to 35,000 bp. Among them, the genome of $phi$C2 was the smallest and that of $phi$C1 was the biggest, while others were in the middle of the size.

키워드

Coliphage Phylogeny RAPD T$_{odd}$ phages T$_{even}$ phages ${phi}{lambda}$

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