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산화환원 효소의 최적 pH 예측
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  • 산화환원 효소의 최적 pH 예측
저자명
김진련,양지혜,유영제,Kim. Jin Ryeon,Yang. Ji Hye,Yu. Yeong Je
간행물명
대한화학회지
권/호정보
2002년|46권 5호|pp.432-449 (18 pages)
발행정보
대한화학회
파일정보
정기간행물|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

본 논문에서는 산화 환원 효소의 최적 pH를 예측해 보았다. Boltzman 분배를 이용하여 어떤 아미노산의 side chain이 물에서 발견될수 있는 상대적 확률이나 물에 대한 상대적 친화력을 구하였으며 p$K_R$을 이용해 protonated 아미노산의 양과 deprotonated 아미소산의 양을 계산하였다. 효소의 최적 pH는 아미노산의 side chain이 물에서 발견될수 있는 상대적 확률과 protonated 또는 deprotonated된 아미노산 양의 곱인 유효 protonated된 양과 유효 depotonated된 양이 같아지는 pH로 예측하였다. 문헌 값과 비교해 보았을 때 예측치는 상당히 일치하는 경향을 보였으며 이 결과 로 효소 자체의 전도도가 생물학적 기능에 있어 매우 중요한 역할을 하는 것을 알 수있다.

기타언어초록

For various oxidoreductases, the optimum pHs of the enzymes can be calculated using the rule based on proton transfer. Relative probability of a certain amino acid side chain to be in the water, or the relative affinity to the water was calculated using Boltzman distribution. Also, the protonated and deprotonated portions of a certain amino acid side chain were calculated using p$K_R$ of that and the effective protonated and deprotonated protions were the product of relative probability and the protonated and deproteonated protions. Where the total effective protonated portion was equal to the effective deprotonated portion of amino acid side chains, it was expected that oxidoreductases have max-imum activities. The optimum pHs calculated by our rule were compared with the experimental results.