기관회원 [로그인]
소속기관에서 받은 아이디, 비밀번호를 입력해 주세요.
개인회원 [로그인]

비회원 구매시 입력하신 핸드폰번호를 입력해 주세요.
본인 인증 후 구매내역을 확인하실 수 있습니다.

회원가입
서지반출
Linear-Time Search in Suffix Arrays
[STEP1]서지반출 형식 선택
파일형식
@
서지도구
SNS
기타
[STEP2]서지반출 정보 선택
  • 제목
  • URL
돌아가기
확인
취소
  • Linear-Time Search in Suffix Arrays
  • Linear-Time Search in Suffix Arrays
저자명
심정섭,김동규,박희진,박근수,Sin. Jeong SeoP,Kim. Dong Kyue,Park. Heejin,Park. Kunsoo
간행물명
정보과학회논문지. Journal of KIISE. 시스템 및 이론
권/호정보
2005년|32권 5호|pp.255-259 (5 pages)
발행정보
한국정보과학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
서지반출

영문초록

계산 생물학이나 문자열 연구 분야에 다양하게 웅용되는 패턴 탐색 문제에 접미사 트리와 접미사 배열과 같은 인덱스 자료구조가 널리 사용되어 왔다. 접미사 트리를 이용한 패턴 탐색이 접미사 배열을 이용한 탐색보다 시간 복잡도 관점에서 더 빠른 것으로 알려져 왔다. 즉, 상수 크기의 알파벳에 대해 패턴 P를 길이 n인 텍스트에서 탐색하기 위해 접미사 트리는 O(${mid}P{mid}$)시간이 필요한 반면 접미사 배열은 O(${mid}P{mid}+ logn$) 시간이 필요하다. 본 논문에서는 상수 크기 알파벳에 대해 접미사 배열을 이용한 선형시간 탐색 알고리즘을 제시한다. 본 알고리즘은 일반적인 알파벳 $Sigma$에 대해서는 O(${mid}P{mid}log{mid}{Sigma$)시간이 필요하다.

기타언어초록

To search a pattern P in a text, such index data structures as suffix trees and suffix arrays are widely used in diverse applications of string processing and computational biology. It is well known that searching in suffix trees is faster than suffix ways in the aspect of time complexity, i.e., it takes O(${mid}P{mid}$) time to search P on a constant-size alphabet in a suffix tree while it takes O(${mid}P{mid}+logn$) time in a suffix way where n is the length of the text. In this paper we present a linear-tim8 search algorithm in suffix arrays for constant-size alphabets. For a gene.al alphabet $Sigma$, it takes O(${mid}P{mid}log{mid}{Sigma}{mid}$) time.