순천만 갯벌에 존재하는 미생물의 다양성을 세포외 효소 활성과 16S rDNA 분석으로 조사하였다. 수초 주변과 갯벌에서 채취한 시료에서 얻은 배양 가능한 균 중에서 4개의 균주를 대상으로 CMCase, xylanase와 protease의 활성을 조사한 결과 2, 3, 27, 그리고 30번 4균주 모두 xylan 분해능이 가장 뛰어났다. 각각의 효소 활성의 최적 온도는 $50{sim}70^{circ}C$로 나타났고, 수초 주변과 갯벌 시료에 따른 차이는 거의 없었다. 갯벌 내 세균 군집을 조사하기 위해 메타게놈 DNA를 분리한 후 증폭된 16S rDNA를 갖는 약 2,000개의 클론을 얻어 그 다양성을 조사하였다. 제한효소 절단 양상으로부터 선별된 17개의 클론을 분석한 결과 클론들의 평균 유사도는 97.3%이었으며, 그 범위는$91.0{sim}99.9%$를 보였고, 4번, 7번, 9번, 101번, 104번, 107번을 제외한 나머지 11개는 uncultured strain들로 확인되었다. 이들은 Proteobacteria, Bacteroidetes, Flavobacteria, Verrucomicrobia, Acidobacteria, Firmicutes, 그리고 Chloroflexi의 7개의 그룹으로 구분할 수 있었다. 9개 (52.9%)의 클론은 Proteobacteria, 3개(17.6%)의 클론은 Firmicutes에 속하였으며, 나머지 그룹에는 각각 1개씩의 클론이 해당되었다. Proteobacteria중에서는 황원소의 산화와 환원에 관여하는 gamma Proteobacteria의 비율이 높게 나타났다. 본 연구의 결과 순천만 갯벌은 미생물 다양성을 유지하고 있으며, 분석된 클론의 65% 가량은 배양되지 않은 미생물로 조사되었다. 이 갯벌로부터 메타게놈 라이브러리를 제작하여 보다 다양한 유전자원을 확보할 수 있을 것으로 판단된다.
Diversity of the mud flat microbial population in Suncheon Bay was investigated by studying extracellular enzyme activities and 16S rDNA sequences. Four culturable bacterial strains with CMCase, xylanase and protease activities were isolated from the wetland and the mud flat. All the strains produced more xylanase activity than CMCase or protease activity, and the properties of the isolate enzymes from the wetland were similar to those from the mud flat. About 2,000 clones were obtained with the 16S rDNA amplified from the metagenomic DNA isolated from the mud samples. Based on the restriction pattern(s), seventeen clones were selected for base sequence analysis. Of the 17 clones, only 35% (6 clones) were found to be cultured strains and 65% (11 clones) to be uncultured strains. The similarities in the base sequences of the clones ranged from 91.0% to 99.9% with an average similarity of 97.3%. The clones could be divided into 7 groups, Proteobacteria (9 clones, 52.9%), Firmicutes (3 clones, 17.6%), Bacteroidetes (1 clone), Flavobacteria (1 clone), Verrucomicrobia (1 clone), Acidobacteria (1 clone), and Chloroflexi (1 clone). Most of the Proteobacteria clones were gamma Proteobacteria associated with oxidation-reduction of sulfur.
