제주재래흑돼지와 Landrace의 상호교차교배를 통하여 생산된 F2 집단에 대해 총 4개의 유전자(ADCYAP1R1, FABP3, MC4R, MYL2)에서 5 좌위의 단일염기변이의 다형성을 조사하고, 성장형질들과 통계적 연관성을 분석하였다. 조사된 5종의 SNP 좌위에서 모두 다형성이 관찰되었으나, FABP3 g.-158T>C 염기치환에 대한 유전자형 중 T/T 동형접합자는 제주재래흑돼지에서는 발견되지 않았고, Landrace에서는 ADCYAP1R1의 intron 2 337 G/G 동형접합자가 발견되지 않았다. ADCYAP1R1 유전자형은 3주령체중, 20주령체중, FABP3 유전자의 g.-135delT에 대한 유전자형은 후기일당증체량에 고도의 유의차를 보였고(P<0.01), g.-158T>G 유전자형은 성장초기단계의 체중, 20주령체중, 후기일당증체량에 대해 고도의 유의차를 나타내었다(P<0.01). MC4R은 초기일당증체량의 차이에 의해 10주령체중의 유의차를 보였고(P<0.05), 후기일당증체량과도 고도의 유의차를 나타내었다(P<0.01). F2의 체장은 ADCYAP1R1, MC4R, MYL2 유전자형에 대한 통계적 유의차를 나타내었으나(P< 0.05), 이중 MC4R의 유전자형에 따른 체장의 차이가 가장 큰 폭으로 확인되었다. 본 연구의 결과들은 제주재래흑돼지와 관련된 다원교잡체계를 이용한 양돈산업에서 성장형질의 생산성 향상을 위한 제주재래흑돼지 종모돈의 선발이나, 제주재래흑돼지 품종 자체의 품종개량을 위한 분자육종체계 구축에서 유용한 기초자료가 될 것으로 사료된다.
Genetic polymorphisms was investigated at five single nucleotide polymorphisms(SNP) sites in four porcine genes(ADCYAP1R1, FABP3, MC4R, and MYL2) and analyzed their statistical association with growth traits in F2 reciprocal-crossbred population between Landrace and Jeju native black pig(JNP). All populations, JNP, Landrace and their F2 were polymorphic for all five SNP loci tested, however, the homozygote T/T of FABP3 g.-158T>C and the homozygote G/G of ADCYAP1R1 intron 2 337A>G were not found in JNP and Landrace, respectively. The genotypes of ADCYAP1R1 were significantly associated with body weights(BW) at 3 weeks and at 20 weeks(P<0.05), respectivley, those of FABP3 g.-135delT were associated with late average daily gain(LADG) (P<0.01), and those of FABP3 g.-158T>G were associated with body weights during late growth period such as, BW20 and LADG(P<0.01). Those of MC4R were also significantly associated with BW10 suggesting by the difference of early average daily gain(EADG) (P<0.05), and with LADG(P<0.01). The body length of F2 animals was affected by the genotypes of ADCYAP1R1, MC4R, and MYL2(P<0.05), respectively. Among these, MC4R A/A homozygotes showed over 3 cm longer in body length than those of other genotypes. As the useful basic information, these results suggested that SNP markers showing statistical association with growth traits and the results help to select the sires of JNP for improving the productivity in JNP-related crossbreeding system in pig industry and also to construct the molecular breeding system for breed improvement of JNP itself.
