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거리반경기반 대표문자열 문제의 NP-완전
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  • 거리반경기반 대표문자열 문제의 NP-완전
저자명
나중채,심정섭,Na. Joong-Chae,Sim. Jeong-Seop
간행물명
정보과학회논문지. Journal of KIISE. 시스템 및 이론
권/호정보
2009년|36권 3호|pp.135-139 (5 pages)
발행정보
한국정보과학회
파일정보
정기간행물|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

여러 문자열들을 비교하여 유사성 또는 거리(오차)를 계산하는 문제는 패턴매칭, 웹검색 바이오인포매틱스, 컴퓨터 보안 등 다양한 응용 분야와의 연관성으로 인해 활발히 연구되어 왔다. 주어진 문자열 집합 내의 여러 문자열들의 거리를 비교하기 위해 주어진 집합 내의 모든 문자열들을 대표하는 한 문자열(대표문자열)을 찾는 방법이 있다. 대표문자열 방법은 주어진 문자열 집합과 가장 유사한 한 문자열을 찾는 방법으로 주로 이용되는 목적함수는 거리반경과 거리합이 있다. 거리반경은 집합 내의 문자열들과 특정 문자열과의 거리들의 최대값으로 정의되며, 모든 문자열들 중에서 최소의 거리반경을 만드는 문자열을 주어진 문자열 집합에 대한 거리반경기반 대표문자열이라 한다. 거리합은 집합 내의 문자열들과 특정 문자열과의 거리들의 합으로 정의되며, 모든 문자열들 중에서 최소의 거리합을 만드는 문자열을 주어진 문자열집합에 대한 거리합기반 대표문자열이라 한다. 본 논문에서는 메트릭 거리함수에 대해 거리반경기반 대표문자열 문제가 NP-완전임을 증명한다.

기타언어초록

The problems to compute the distances or similarities of multiple strings have been vigorously studied in such diverse fields as pattern matching, web searching, bioinformatics, computer security, etc. One well-known method to compare multiple strings in the given set is finding a consensus string which is a representative of the given set. There are two objective functions that are frequently used to find a consensus string, one is the radius and the other is the consensus error. The radius of a string x with respect to a set S of strings is the smallest number r such that the distance between the string x and each string in S is at most r. A consensus string based on radius is a string that minimizes the radius with respect to a given set. The consensus error of a string with respect to a given set S is the sum of the distances between x and all the strings in S. A consensus string of S based on consensus error is a string that minimizes the consensus error with respect to S. In this paper, we show that the problem of finding a consensus string based on radius is NP-complete when the distance function is a metric.