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효모 마이크로어레이 유전자발현 데이터에 대한 군집화 비교
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  • 효모 마이크로어레이 유전자발현 데이터에 대한 군집화 비교
저자명
이경아,김재희,Lee. Kyung-A,Kim. Jae-Hee
간행물명
한국데이터정보과학회지
권/호정보
2011년|22권 4호|pp.741-753 (13 pages)
발행정보
한국데이터정보과학회
파일정보
정기간행물|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

마이크로어레이 유전자 발현데이터인 효모데이터를 이용하여 군집분석을 실시하였다. 모형기반 군집방법, K-평균법, 중앙값 중심분포 (PAM), 자기 조직화 지도 (SOM), 계층적 Ward 군집방법을 이용하여 군집화를 실시하고, 연결성 측도 (connectivity), Dunn지수, 실루엣 측도 (silhouette)를 이용하여 각 군집방법에 대한 유효성을 측정하고 군집분석 결과를 비교하고자한다.

기타언어초록

We accomplish clustering analyses for yeast cell cycle microarray expression data. We compare model-based clustering, K-means, PAM, SOM and hierarchical Ward method with yeast data. As the validity measure for clustering results, connectivity, Dunn Index and silhouette values are computed and compared.