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A Program for Efficient Phasing of Three-Generation Trio SNP Genotype Data
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  • A Program for Efficient Phasing of Three-Generation Trio SNP Genotype Data
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저자명
Song. Sang-Hoon,Kim. Sang-Soo
간행물명
Genomics & informatics
권/호정보
2011년|9권 3호|pp.138-141 (4 pages)
발행정보
한국유전체학회
파일정보
정기간행물|ENG|
PDF텍스트
주제분야
기타
이 논문은 한국과학기술정보연구원과 논문 연계를 통해 무료로 제공되는 원문입니다.
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기타언어초록

Here, we report a computer program written in Python, which phases SNP genotypes and infers inherited deletions based on the pattern of Mendelian inheritance within a trio pedigree. When tiered trio genotypes that encompass three generations are available, it narrows a recombination event down to a region between two consecutive heterozygous markers. In addition, the phase information that is inferred from the upper trio that is formed by one of the parents and grandparents can be propagated to phase the genotypes of the lower trio that is formed by the parents and an offspring.