인체에 존재하는 다양한 미생물에 대한 연구는 최근에 발달한 next-generation sequencing 기법의 도입과 함께 눈부시게 발전하고 있다. 가장 대표적인 분석 기반으로는 Roche-454와 Illumina가 있다. Roche-454는 400 bps 내외의 비교적 긴 염기 서열을 단 시간 이내 읽어 들일 수 있는 장점이 있고, Illumina는 100~150 bps의 짧은 염기 서열을 분석하는 반면 방대한 양의 정보를 읽어 들일 수 있는 장점을 갖는다. 이러한 분석의 특징과 장 단점을 비교하고 더불어 최근에 소개되고 있는 PacBio, Oxford Nanopore 등에 대한 소개도 곁들이고자 한다.
Vast array of microbes colonize to each anatomical environment of human body. Culture based methods are important in investigating the microbial structure, but they are extremely biased in their evaluation of microbial diversity by selecting particular population of microbiota. Recent advance in molecular technology has allowed sophisticated analysis of complex human microbiota by culture-independent methods. Here, we will discuss features of tools for human microbiota studies including Roche-454 and Illumina platform. We will also briefly discuss features of some strategies that are commonly applied to these platforms including 16S rRNA targeting and shotgun sequencing. New platforms such as PacBio and Oxford Nanopore are also introduced.
