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Campylobacter jejuni, C. coli, Arcobacter butzleri와 Helicobacter pylori의 PCR에 의한 분리검출
이영덕, 박종현, Lee. Young-Duck, Park. Jong-Hyun 한국식품과학회 한국식품과학회지 6 Pages
한국식품과학회 한국식품과학회지 2002, Vol.34 No.6 1134-1139 (6 pages)
및 신경 장애를 유발한다. Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter를 오염된 식품 등에서 선택적으로 검출하기 위해 PCR, multiplex-PCR, RFLP(restriction fragment length polymorphism)의 기법을 이용하였다. Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter의 16S rRNA를 target으로 하는 CHA primer를 사용하여 동일한 PCR product의 검출할 수 있었다. C. jejuni와 C.coli를 A. butzleri와 H. pylori로부터 선택적으로 검출하기 위해 fla A gene을 target으로 하는 pg3, p50을 사용하였으며, A. butzleri는 23S rRNA를 target으로 하는... -
Differentiation of Lactic Acid Bacteria Based on RFLP Analysis of the tuf Gene
Park. Seok-Hwee, Jung. Jong-Hyun, Seo. Dong-Ho, Lee. Hye-Lim, Kim. Gye-Won, Park. Sun-Young, Shin. Woo-Chang, Hong. Sung-Youl, Park. Che 한국식품과학회 Food science and biotechnology 5 Pages
한국식품과학회 Food science and biotechnology 2012, Vol.21 No.3 911-915 (5 pages)
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마늘(Allium sativum L.) 게놈의 고반복서열의 분이와 특성 조사
이동희 한국식물학회 Journal of plant biology 7 Pages
한국식물학회 Journal of plant biology 1996, Vol.39 No.1 49-55 (7 pages)
해당되는 부분을 분리하고, 클로닝하였다. 이들 고반복서열 클론의 게놈 내의 copy수는 대체적으로 $10^{5}~10^{7}$이었다. 이 중 일부 클론의 염기서열과 분석한 결과, G/C 함량은 25~40% 정도로 낮았고, 일부서열의 내부에서는 소단위의 염기서열이 반복배열되어 있었다. 단양을 비롯한 문경, 서산, 의성 품종 사이에서 해당 반복서열의 변이정도를 조사하기 위하여, 다섯종류의 고반복서열을 탐침으로 이들 품종 마늘에 대한 RELP(restriction fragment length polymorphism)분석을 한 결과 이들 서열의 유전적변이는 거의 나타나지... -
조기 난소 부전증(Premature Ovarian Failure, POF) 환자에서 난포 자극 호르몬 수용체 유전자 변이 및 발현 양상에 대한 분석
김정욱, 염혜원, 이형송, 송견지, 천강우, 박용석, 김계현 한국발생생물학회 발생과 생식 6 Pages
한국발생생물학회 발생과 생식 2000, Vol.4 No.1 61-66 (6 pages)
(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)을 시행한 결과, 대조군과 조기 난소 부전증 환자군 모두에서 돌연변이를 관찰할 수 없었다. 난포 자극 호르몬 수용체의 발현양상을 확인하기 위해 시험관아기 시술과정 중 난자 채취과정에서 얻어진 황체화 과립세포에서 total RNA를 추출하여 역전사 중합효소 연쇄 반응을 시행하였다. 반응 산물을 전기 영동하여 발현양상을 비교해 본 결과, 대조군에 비해 조기 난소 부전증 환자군에서 난포 자극 호르몬 수용체 유전자의 발현이 다소 낮은 것으로 확인되었다. 이상의 결과로 보아... -
농법에 따른 메탄생성과 메탄생성 세균의 T-RFLP 패턴
김훈수, 조주식, 박경량, Kim. Hun-Soo, Cho. Ju-Sik, Park. Kyeong-Ryang 한국미생물학회 미생물학회지 9 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2009, Vol.45 No.1 17-25 (9 pages)
메탄생성 세균의 수, 그리고 terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) 패턴을 계절별로 조사하였다. 조사기간 동안의 대부분 토양 성분은 큰 차이를 나타내지 않았고, 토양내 물 함량은 5월 시료 보다 10월 시료가 높게 나타났다. 그리고 most probable number (MPN) 방법을 이용한 메탄생성 세균 계수에서, 모든 논토양에 메탄생성 세균이 비교적 많이 존재하였으나 수소를 이용하는 메탄생성 세균과 포름산을 이용하는 메탄생성 세균에 비해 아세트산을 이용하는 메탄 세균수가 상대적으로 적은 것을 확인하였다.... -
16S rDNA-RFLP에 의한 Spirastrella abata와 Spirastrella panis 해면에 서식하는 배양가능한 공생세균 군집의 비교
조현희, 박진숙, Cho. Hyun-Hee, Park. Jin-Sook 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2009, Vol.45 No.2 155-162 (8 pages)
RFLP (restriction fragment length polymorphism) 분석을 위한 제한효소로 HaeIII와 MspI을 이용하였으며, 그 결과 24개의 RFLP type을 구별할 수 있었다. 각 패턴별로 1~5개의 분리균주를 선별하여 부분 염기서열 분석 결과, 알려진 세균 종과 98.4% 이상의 유사도를 나타내었으며 2종의 Spirastrella 해면으로부터 분리된 세균들은 모두 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria 4개의 강(class)에 포함되었다. Alphaproteobacteria는 S. abata에서 39.3%, S. panis에서 47.6%가 관찰되어 두 해면에서... -
폐수처리장치에서의 아질산염 산화 세균 군집 분석
정순재, 이상일, 이동훈, Jeong. Soon-Jae, Lee. Sang-Ill, Lee. Dong-Hun 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2008, Vol.44 No.1 29-36 (8 pages)
의해 아질산염으로 산화되며, 그 후에 아질산염은 아질산염 산화세균에 의해 질산염으로 산화된다. 실험실 규모의 생물학적 질소제거 시스템인 변형된 eBAF 시스템, Nutrient removal laboratory 시스템과 반추기법을 적용한 rSBR 시스템의 질산화반응조 시료에서 16S rRNA 유전자를 이용한 terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) 방법으로 아질산염 산화세균군집을 분석하였다. 제한효소로 형성된 단편의 클러스터분석에서 Nitrobacter 군집은 각각의 폐수처리 시스템에 따라 군집의 차이가 있음이 나타났다.... -
아미노산 액비를 처리한 들잔디 토양 미생물 군집구조 및 다양성
김동일, 김동훈, Kim. Dong-Il, Kim. Dong-Hun 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2006, Vol.42 No.2 103-110 (8 pages)
위하여 16S rDNA서열에 기초한 T-RFLP (terminal restriction fragment length polymorphism)분식과 클론의 염기서열 분석을 실시하였다. 제한효소 HaeIII을 이용한 T-RFLP 분석결과 아미노산 액비를 처리한 실험구 KD3과 KD4에서, 32, 38개의 유효한 피크를 가진 T-RFs가 나타났다. 23개를 나타낸 아미노산 무처리구인 KD2가 KD3,4에 비해 미생물군집구조가 단순한 것으로 조사되었다. 네 개의 실험구 KDl (대조구), KD2 (무처리구), KD3 (LFcAA 1X)., KD4 (LFcAA 2X)에서 각각 110개의 클론의 16S rDNA부분 염기서열 분석결과 대부분이... -
Biological Nitrogen Removal System의 세균 군집 분석
김경미, 이상일, 이동훈, Kim. Kyung-Mi, Lee. Sang-Ill, Lee. Dong-Hun 한국미생물학회 미생물학회지 8 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2006, Vol.42 No.1 26-33 (8 pages)
PCR 및 terminal restriction fragment length polymorphism (T-RELP)방법을 이용하여 분석하였다. 본 연구에서 사용한 BNR 시스템은 국내에서 비교적 많이 적용되고 있는 부상여재를 이용한 고도처리 시스템, Nutrient Removal Laboratory 시스템, 반추기법을 이용한 영양염류 처리 Sequencing Batch Reactor (SBR)시스템이었고, 실험 결과 모든 시료에서 암모니아 산화 세균과 $eta-proteobacteria$에 해당되는 말단 단편을 확인할 수 있었다. 암모니아 산화세균 군집에서 유래된 말단 단편의 염기서열을 분석한 결과 SBR공정에서는... -
cpcBA-Intergenic Spacer Region을 이용한 Cyanobacteria의 다양성 분석
최강국, 박용하, 안치용, 배명숙, 오희목, Choi. Gang-Guk, Park. Yong-Ha, Ahn. Chi-Yong, Bae. Myoung-Sook, Oh. Hee-Mock 한국미생물학회 미생물학회지 6 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 2005, Vol.41 No.4 287-292 (6 pages)
Spacer (IGS)는 cyanobacteria에 특징적 색소인 phycocyanin을 합성하는 유전자와 유전자 사이의 부분으로, 환경시료에서 cyanobacteria의 다양성을 조사하기에 매우 유용한 기능 유전자이다. cpcBA-IGS를 이용하여 restriction fragment length polymorphism (RELP)으로 cyanobacteria의 다양성을 분석한 결과 Phomidium 속은 58 clones, Anabaena 속은 14 clones, Microcyxtis 속은 4 clones, Spirulina 속은 1 clone 그리고 uncultured cyanobacteria 2 clones가 존재하였다. 전반적으로 Phormidium 속이 우점하였으며, 여름철에 수...