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321.

마이크로어레이 실험과 이미지를 위한 품질제어

김판규, 조환규, Kim. Pan-Gyu, Cho. Hwan-Gue 한국유전체학회 유전체소식 6 Pages

한국유전체학회 유전체소식 2003, Vol.3 No.4 10-15 (6 pages)

김판규, 조환규, Kim. Pan-Gyu, Cho. Hwan-Gue 저

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322.

식품 위해 미생물 검출을 위한 DNA 마이크로어레이 기술

정효암, 최호석, 김민곤, Joung. Hyou-Am, Choi. Ho-Suk, Kim. Min-Gon 한국식품위생안전성학회 Safe food 7 Pages

한국식품위생안전성학회 Safe food 2006, Vol.1 No.4 24-30 (7 pages)

정효암, 최호석, 김민곤, Joung. Hyou-Am, Choi. Ho-Suk, Kim. Min-Gon 저

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323.

미세유체 바이오칩을 이용한 DNA 마이크로어레이 Hybridization 향상

이현호, 김용상, Lee. H.H., Kim. Y.S. 한국생물공학회 한국생물공학회지 6 Pages

한국생물공학회 한국생물공학회지 2007, Vol.22 No.6 387-392 (6 pages)

이현호, 김용상, Lee. H.H., Kim. Y.S. 저

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대한 연구가 점차 확장하고 있다. DNA나 RNA 등 유전자의 매우 느린 확산속도를 극복하기 위하여 마이크로플루딕 바이오칩이 DNA 마이크로어레이에 적용되는 최근의 학술적인 사례들을 연구, 비교하였다. DNA 마이크로어레이에 적용된 미세유체 바이오칩은 상당수가 효율적인 hybridization을 달성하기 위한 믹싱 시스템이 많이 보고되었으며, 이 총설에서는 그에 대한 분석을 수행하여 유전자 hybridization 강화를 이룬 시스템에 대한 최근 동향을 가늠할 수 있게 하였다. 특별히 PDMS를 이용한 마이크로 펌프의 적용 등, 앞으로의...
324.

DNA 마이크로어레이 시스템 분석을 통한 S. lividans 유래 항생제 조절유전자 afsR2 기능 분석

김창영, 노준희, 이한나, 김응수, Kim. Chang-Young, Noh. Jun-Hee, Lee. Han-Na, Kim. Eung-Soo 한국생물공학회 KSBB Journal 8 Pages

한국생물공학회 KSBB Journal 2009, Vol.24 No.3 259-266 (8 pages)

김창영, 노준희, 이한나, 김응수, Kim. Chang-Young, Noh. Jun-Hee, Lee. Han-Na, Kim. Eung-Soo 저

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AfsR2 과발현 S. lividans TK21을 이용하여 DNA microarray를 수행하였다. 그 결과, phosphate starvation과 관련 있는 42개의 유전자들이 up-regulated 되었으며, 특히 SCO4139 (pstB, phosphate ABC transport system ATP-binding protein)와 SCO4142 (pstS, phosphate-binding protein precursor)는 afsR2가 phosphate와 같은 nutrient starvation에 적극적으로 관여한다는 것을 나타내며, SCO4228 (putative phosphate transport system regulatory protein)은 기존에 수행되었던 2D-electrophoresis 연구나 afsS null S....
325.

마이크로어레이를 이용한 애기장대 AtERF71/HRE2 전사인자의 하위 유전자 분석

석혜연, 이선영, 우동혁, 박희연, 문용환, Seok. Hye-Yeon, Lee. Sun-Young, Woo. Dong-Hyuk, Park. Hee-Yeon, Moon. Yong-Hwan 한국생명과학회 생명과학회지 12 Pages

한국생명과학회 생명과학회지 2012, Vol.22 No.10 1359-1370 (12 pages)

석혜연, 이선영, 우동혁, 박희연, 문용환, Seok. Hye-Yeon, Lee. Sun-Young, Woo. Dong-Hyuk, Park. Hee-Yeon, Moon. Yong-Hwan 저

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의해 직, 간접적으로 발현이 조절되는 하위 유전자를 알아보기 위해 AtERF71/HRE2 과발현체를 대상으로 마이크로어레이 실험을 수행하였다. 야생형에 비해 AtERF71/HRE2 과발현체에서 발현이 2배 이상 증가한 기능이 알려진 유전자는 AtERF71/HRE2 자신을 제외하고 161개였다. 161개 유전자 중 전사인자와 DNA-결합 단백질 등과 같은 전사조절자가 24개로 확인되어, AtERF71/HRE2는 하위 전사조절 유전자의 발현 조절을 통해 더 많은 유전자의 발현을 조절하는 상위 전사인자로서의 기능을 가질 것으로 추정되었다. 161개 유전자 중 15개...
326.

마이크로어레이 실험 및 분석 데이터 처리를 위한 통합 관리 시스템의 설계와 구현

이미경, 최정현, 조환규 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 9 Pages

한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 2003, Vol.31 No.2 182-190 (9 pages)

이미경, 최정현, 조환규 저

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데이터 요소를 바탕으로 데이터 스키마를 설계하였으며 마이크로어레이 실험 설계에 따라 체계적으로 데이터를 관리하기 위해서 공동적인 데이터 단위를 정의하였다. WEMA의 주요 기능은 마이크로어레이 이미지 및 분석 데이터의 효율적인 관리, 데이터입출력의 통합 기능, 메타 파일 생성 등이다. 본 WEMA 시스템을 이용해서 실제로 한 식물 분자 생물학 연구실에서 만들어내는 마이크로어레이 이미지 데이터를 처리, 관리한 결과 생물학자들이 마이크로어레이 데이터를 체계적으로 관리, 분석할 수 있었으며 연구자들간의 데이터 교환...
327.

상대적 계층적 군집 방법을 이용한 마이크로어레이 자료의 군집분석

우숙영, 이재원, 전명식, Woo. Sook Young, Lee. Jae Won, Jhun. Myoungshic 한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 11 Pages

한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 2014, Vol.25 No.5 999-1009 (11 pages)

우숙영, 이재원, 전명식, Woo. Sook Young, Lee. Jae Won, Jhun. Myoungshic 저

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있어서 방대한 양의 마이크로어레이 자료를 탐색하기에 유용하며, 군집된 결과를 이용하여 생물학적 현상을 이해하는데 도움을 준다. 하지만, 계층적 군집방법은 두 군집간의 절대값 거리만을 고려하여 병합하기 때문에 군집 간의 상대적 비유사성은 설명하지 못하는 단점이 있다. 본 연구에서는 상대적 계층적 군집 방법을 소개하고, 마이크로어레이 자료와 같이 다양한 군집의 모양을 가진 모의실험 자료들과 실제 마이크로어레이 자료를 사용하여 상대적 계층적 군집방법과 기존의 계층적 군집 방법을 비교하였다. 두 계층적 군집...
328.

마이크로어레이 유전자 발현 자료에 대한 군집 방법 비교

임진수, 임동훈, Lim. Jin-Soo, Lim. Dong-Hoon 한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 13 Pages

한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 2012, Vol.23 No.1 39-51 (13 pages)

임진수, 임동훈, Lim. Jin-Soo, Lim. Dong-Hoon 저

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군집분석은 마이크로어레이 발현자료에서 유전자 혹은 표본들의 유사한 특성을 갖는 연관구조를 조사하는데 중요한 도구이다. 본 논문에서는 마이크로어레이 자료에서 계층적 군집방법, K-평균법, PAM (partitioning around medoids), SOM (self-organizing maps) 그리고 모형기반 군집방법 들의 성능을 3가지 군집 타당성 측도인 내적 측도, 안정적 측도 그리고 생물학적 측도를 가지고 비교분석하고자 한다. 모의실험을 통해 생성된 자료와 실제 SRBCT (small round blue cell tumor) 자료를 가지고 여러 가지 군집방법들의 성능을...
329.

마이크로어레이 자료에서 생존과 유의한 관련이 있는 유전자집단 검색

이선호, 이광현, Lee. Sun-Ho, Lee. Kwang-Hyun 한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 11 Pages

한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 2012, Vol.23 No.1 1-11 (11 pages)

이선호, 이광현, Lee. Sun-Ho, Lee. Kwang-Hyun 저

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환자의 생존시간과 함께 유전자 마이크로어레이 자료가 주어진 경우 생존에 유의한 영향을 미치는 대사경로를 찾는 방법을 연구하였다. 기존의 방법인 유전자 집합 농축도 분석, 글로벌 검정과 왈드 형태 검정을 비교 분석하였고, 치환을 통하여 p값을 구하는 단점을 개선한 수정된 왈드 형태 검정을 제안하였다. 모의실험과 실제자료 분석을 이용하여 새로운 방법의 적용 가능성을 보였다.
330.

효모 마이크로어레이 유전자발현 데이터에 대한 군집화 비교

이경아, 김재희, Lee. Kyung-A, Kim. Jae-Hee 한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 13 Pages

한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 2011, Vol.22 No.4 741-753 (13 pages)

이경아, 김재희, Lee. Kyung-A, Kim. Jae-Hee 저

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마이크로어레이 유전자 발현데이터인 효모데이터를 이용하여 군집분석을 실시하였다. 모형기반 군집방법, K-평균법, 중앙값 중심분포 (PAM), 자기 조직화 지도 (SOM), 계층적 Ward 군집방법을 이용하여 군집화를 실시하고, 연결성 측도 (connectivity), Dunn지수, 실루엣 측도 (silhouette)를 이용하여 각 군집방법에 대한 유효성을 측정하고 군집분석 결과를 비교하고자한다.

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