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DNA Microarray and Gene Ontology Enrichment Analysis Reveals That a Mutation in opsX Affects Virulence and Chemotaxis in Xanthomonas oryzae pv. oryzae
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2016, 32권 3호 3 190-200 (11 pages)
Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) causes bacterial leaf blight (BLB) in rice (Oryza sativa L.). In this study, we investigated the effect of a mutation in opsX (XOO1056), which encodes a saccharide biosynthesis regulatory protein, on the virulence and bacterial chemotaxis of Xoo. We performed DNA microarray analysis, which showed that 63 of 2,678 genes, including genes related to bacterial motility (flagellar and chemotaxis proteins) were significantly downregulated (<−2... -
한국 선사고고학의 방법론적 전망
안승모 한국고고학회 한국고고학전국대회 발표문 22 Pages
한국고고학회 한국고고학전국대회 발표문 제38회 한국고고학대회 1 31-52 (22 pages)
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Time-dependent proteomic and genomic alterations in Toll-like receptor-4-activated human chondrocytes: increased expression of lamin A/C and annexins
SeungHeeHa, HyoungKyuKim, NguyenThiTuyetAnh, NariKim, KyungSooKo, ByoungDooRhee, JinHan 대한생리학회-대한약리학회 The Korean Journal of Physiology & Pharmacology 16 Pages
대한생리학회-대한약리학회 The Korean Journal of Physiology & Pharmacology 2017, Vol.21 No.5 8 531-546 (16 pages)
by microarray and gene ontology analyses. Proteomics analysis identified 26 proteins with significantly altered expression levels; these proteins were related to the cytoskeleton and oxidative stress responses. Gene ontology analysis indicated that LPS treatment altered specific functional pathways including ‘chemotaxis’, ‘hematopoietic organ development’, ‘positive regulation of cell proliferation’, and ‘regulation of cytokine biosynthetic process’. Nine of the 26 identified proteins... -
Necrotrophic Fungus Pyrenophora tritici-repentis Triggers Expression of Multiple Resistance Components in Resistant and Susceptible Wheat Cultivars
Ethan J. Andersen, Madhav P. Nepal, Shaukat Ali 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 16 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2021, 37권 2호 2 99-114 (16 pages)
Tan spot of wheat, caused by Pyrenophora tritici-re- pentis (Ptr), results in a yield loss through chlorosis and necrosis of healthy leaf tissue. The major objective of this study was to compare gene expression in resistant and susceptible wheat cultivars after infection with Ptr ToxA-producing race 2 and direct infiltration with Ptr ToxA proteins. Greenhouse experiments included ex- posure of the wheat cultivars to pathogen inoculum or direct infiltration of leaf tissue with Ptr-ToxA protein... -
Suppression of Rice Stripe Virus Replication in Laodelphax striatellus Using Vector Insect-Derived Double-Stranded RNAs
Ying Fang, Jae Young Choi, Dong Hwan Park, Min Gu Park, Jun Young Kim, Minghui Wang, Hyun Ji Kim, Woo Jin Kim, Yeon Ho Je 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 9 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2020, 36권 3호 8 280-288 (9 pages)
RNA interference (RNAi) has attracted attention as a promising approach to control plant viruses in their insect vectors. In the present study, to suppress replication of the rice stripe virus (RSV) in its vector, Laodelphax striatellus, using RNAi, dsRNAs against L. striatellus genes that are strongly upregulated upon RSV infection were delivered through a rice leaf-medi- ated method. RNAi-based silencing of peroxiredoxin, cathepsin B, and cytochrome P450 resulted in significant down regulation... -
Profiling of Disease-Related Metabolites in Grapevine Internode Tissues Infected with Agrobacterium vitis
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2016, 32권 6호 1 489-499 (11 pages)
Green shoot cuttings of 10 different grapevine species were inoculated with Agrobacterium vitis to find disease-related metabolites in the grapevine. Crown galls formed 60 days after inoculation varied in gall severity (GS) evaluated by gall incidence (GI) and gall diameter (GD), which were classified into three response types as RR (low GI and small GD), SR (high GI and small GD), and SS (high GI and large GD), corresponding to resistant, moderately resistant, and susceptible responses,... -
Research Notes : Transcriptome Analysis of the Small Brown Planthopper, Laodelphax striatellus Carrying Rice stripe virus
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 8 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2013, 29권 3호 12 330-337 (8 pages)
by 454 pyrosequencing to construct 1,538 and 953 of isotigs from the mRNA of RVLS and NVLS, respectively. The gene ontology (GO) analysis demonstrated that both libraries have similar GO structures, however, the gene expression pattern analysis revealed that 17.8% and 16.8% of isotigs were up- and down-regulated significantly in the RVLS, respectively. These RSV-dependently regulated genes possibly have important roles in the physiology of SBPH, transmission of RSV, and RSV and SBPH interaction. -
Research Articles : RNAseq-based Transcriptome Analysis of Burkholderia glumae Quorum Sensing
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2013, 29권 3호 4 249-259 (11 pages)
A comparison of gene expression profiling among the wild-type BGR1 and the two mutants before and after QS onset as well as gene ontology (GO) enrichment analysis from differential expressed genes (DEGs) revealed that genes involved in motility were highly enriched in TofI-dependent DEGs, whereas genes for transport and DNA polymerase were highly enriched in QsmR-dependent DEGs. Further, a combination of pathways with these DEGs and phenotype analysis of mutants pointed to a couple of metabolic... -
비판이론을 통한 국내 통합교육 개념 및 현실에 대한 고찰
강종구(Jong Gu Kang) 인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 9 Pages
인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 2019, 제 9권 제 2호 32 321-329 (9 pages)
본 연구는 비판이론의 관점을 통해 국내에서 다루어지고 있는 통합교육의 개념과 현실을 알아보고자 하였다. 본 연구의 결과는 다음과 같다. 첫째, 국내 통합교육 개념은 통합교육의 발달 단계 및 용어를 충분히 반영하지 못하고 있다. 본 연구에서는 통합교육의 개념을 장애학생에게 친화적인 개념으로 변경하기 위하여 국내 통합교육에서 사용되고 있는 개념 및 용어를 비판적 시각으로 접근할 필요가 있음을 보여주고 있다. 둘째, 본 연구는 통합교육과 관련된 현실로서 통합교육에 영향을 미치는 인적 요인은 통합교육에 영향을... -
인체자원은행의 효율적인 운영을 위한 OWL 기반의 데이터베이스 구축에 관한 연구
이상민, 김화선, 조훈 인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 10 Pages
인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 2015, 제 5권 제 3호 7 55-64 (10 pages)
본 연구에서는 인체자원은행의 효율적인 운영과 인체자원은행간의 상호호환을 위해 온톨로지 기반 의 데이터베이스를 구축하였다. 본 연구팀은 선행연구에서 7,197,252개의 인체자원정보를 수집하여 고 품질 인체자원정보 데이터베이스를 구축하였다. 이 과정에서 1,796개의 임상항목을 분류하고 명확한 용어표현을 위해 국제표준용어체계인 SNOMED-CT와 매핑하였다. 그 결과 동일한 국제표준코드에 대 해 서로 다른 용어 및 값 유형, 자료 형을 가지는 826개의 유의어를 발견하였다. 본 연구에서는 유의 어로 인한 중복을 최소화하기... -
웹기반 협력문제해결에 미치는 컨셉맵 구성의 영향: 고차적 사고를 위한 컴퓨터화된 스케폴딩으로
김현아 한국성인교육학회 Andragogy Today 24 Pages
한국성인교육학회 Andragogy Today 2004, Vol.7 No.2 6 176-210 (24 pages)
본 연구의 목적은 두 가지로 나뉜다. 첫 번째 목적은, 질적인 방법의 예비연구로서, “도구적 발 생”(Genese instrumentale, Rabardel, 1995)의 측면에서, 세 요인들 - 컴퓨터화된 컨셉맵 협력구성도 구, Knoware 의 특성, 실시간 온라인 협력학습에 참여한 두 명의 조원, 학습과제의 특성- 간의 상 호 작용의 양태를 분석하여 논증적 토의를 활발하게 유발하는 협력학습 과제를 분석하는 것이었다. 두 번째 목적은, 실험을 통하여, 실시간 온라인 협력문제해결과정에서, 선형적 텍스트 표상의 커뮤 니케이션 도구, Chat와 비교 했을 때... -
라이프스킬 중심 체육수업을 위한 교사 전문성 프로그램 개발 및 최적화 과정 탐색
이옥선, 최의창, 손혁준, 정현수, 조기희 이화여자대학교 교과교육연구소 교과교육학연구 11 Pages
이화여자대학교 교과교육연구소 교과교육학연구 2019, 제 23권 4호 6 335-345 (11 pages)
본 연구의 목적은 핵심역량 중심의 체육과 교육과정을 실천하기 위한 구체적인 방법으로서, 라이프스킬 중심의 체육수업지도를 위한 교사 전문성 프로그램의 개발 및 최적화 과정을 탐색하는 데 있다. 이를 위하여 첫째, 중등 체육교사 (n=251)를 대상으로 온라인 설문지와 반구조적 면담(n=20)을 통해 교사의 요구를 분석하였다. 둘째, 2015개정 체육과 교육과정을 분석하고 효과적인 교사전문성 프로그램 개발의 원리(O’Sullivan & Deglau, 2006)와 기본요구이론(basic needs theory)에 기초한 라이프스킬 모델(Hodge et al., 2013)을... -
이질적인 쇼핑몰 환경을 위한 온톨로지 기반 상품 매핑 방법론
김우주, 최남혁, 최대우, Kim. Woo-Ju, Choi. Nam-Hyuk, Choi. Dae-Woo 한국지능정보시스템학회 한국 지능정보시스템학회논문지 16 Pages
한국지능정보시스템학회 한국 지능정보시스템학회논문지 2006, Vol.12 No.2 33-48 (16 pages)
"Ontology Alignment"에 대해 집중적으로 다루어 보고자 한다. 이와 더불어, 현재 의미 웹이 지향하는 대표적인 특성 중 하나로써 상호운영성을 꼽을 수 있다. 온톨로지 매핑(Ontology mapping)은 이러한 상호운영성을 지원하기 위한 대표적인 기술로써 각광을 받고 있다. 따라서 우리는 이러한 온톨로지 매핑에 대한 방법론을 쇼핑몰 환경에 적용함으로써 서로 이질적인 상품 카테고리로 구성된 두 쇼핑몰간의 상품에 대한 매핑 알고리즘(Mapping Algorithm)을 제안하고자 한다. 또한, 효용성 검증을 위하여 온톨로지 매핑에... -
분산 환경에서의 쿼리 변환을 위한 온톨로지 매핑 결합
정재은, Jung. Jason J. 한국지능정보시스템학회 지능정보연구 12 Pages
한국지능정보시스템학회 지능정보연구 2008, Vol.14 No.4 19-30 (12 pages)
heterogeneity)을 해결해야 한다. 일반적으로 전문가들에게 미리 온톨로지들 간의 명시적 매핑(explicit mapping between ontologies)을 요청하고 있다. 하지만, 온톨로지 매핑의 고비용성 문제 때문에 모든 정보시스템들의 온톨로지 간의 일대일 매핑이 이루어지기 힘들다. 따라서, 본 논문에서는 분산된 온톨로지들 간의 매핑정보를 수집하고 재사용(reuse) 하고자 한다. 즉, 분산 환경에서 활용 가능한 온톨로지 매핑 정보의 결합(composition)을 위한 방법론을 제안한다. 이를 통해 주어진 두 온톨로지 간의 매핑 정보를 간접적으로... -
표준 의학 용어체계의 매핑을 위한 시스템의 설계 및 개발
이인근, 김화선, 조훈, Lee. In-Keun, Kim. Hwa-Sun, Cho. Hune 한국지능시스템학회 한국지능시스템학회 논문지 7 Pages
한국지능시스템학회 한국지능시스템학회 논문지 2011, Vol.21 No.2 237-243 (7 pages)
의학 분야에서의 다양한 표준 용어체계는 각기 다른 형태로 구성되어 있다. 따라서 이들을 통합하여 활용하기 위해서는 용어체계 사이의 연결 정보가 필요하다. 이를 위해 여러 통합 도구들이 개발되어 사용되고 있으나, 이들 도구들은 특정 용어 체계에 국한하기 때문에, 매핑 데이터의 생성 범위가 제약적이다. 이를 극복하기 위해 여러 용어체계를 통합하여 매핑작업을 수행할 수 있는 도구도 개발되었다. 그러나 의학용어체계는 각각 독특한 형태로 구성되어 있어 이들의 획일적인 통합이 어려운 문제가 있다. 따라서 본 논문에서는... -
시맨틱 웹을 위한 이기종 시스템간의 온톨로지 매핑
홍현술, Hong. Hyeun-Sool 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KISS. 기술교육 8 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KISS. 기술교육 2004, Vol.1 No.1 25-32 (8 pages)
본 논문의 목적은 온톨로지를 기반으로 하는 이질적인 시스템모델을 전체적인 통합에 접근시킨다. 따라서 이질적인 환경의 메타모델에서 핵심 요소를 추출하고, 이들의 의미적인 측면과 구조적인 측면을 고려하여 매핑을 수행한다. 이질적인 환경의 메타모델 사이에 변환은 구조손실의 근본적인 문제론 가진다. 이 문제를 해결하기 위하여 소스와 목표 모델 요소 사이의 관계의 트랙을 보존하고 지원할 수 있는 트래킹 시스템을 도입한다. 본 연구는 시맨틱 웹을 위한 정보의미의 고품질 모델을 구축하는데 효과를 증대시 진 것이다. -
T-MERGE 연산자에 기반한 분산 토픽맵의 자동 통합
김정민, 신효필, 김형주, Kim. Jung-Min, Shin. Hyo-Pil, Kim. Hyoung-Joo 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 15 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 소프트웨어 및 응용 2006, Vol.33 No.9 787-801 (15 pages)
온톨로지 통합은 두 소스 온톨로지들을 통합하여 하나의 새로운 온톨로지를 생성하는 과정으로서 시맨틱 웹, 데이타 통합, 지식관리시스템 등 여러 온톨로지 응용 시스템에서 중요하게 다루는 연구주제이다. 그러나 과거의 연구들은 대부분 두 소스 온톨로지들 사이에 의미적으로 대응되는 공통 요소를 효과적으로 찾기 위한 온톨로지 매칭 기법에 집중되어 있으며 매핑 요소들을 통합하는 과정에서 발생하는 문제를 정의하고 해결하는 방법에 대해서는 간과하고 있다. 본 논문에서는 매칭 프로세스에 의해 주어진 매핑 결과에 기반하여... -
관계형 데이터베이스 뷰 정의로부터 온톨로지 클래스와 계층 관계 생성 기법
양준석, 김기성, 김형주, Yang. Jun-Seok, Kim. Ki-Sung, Kim. Hyoung-Joo 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 10 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 2010, Vol.37 No.6 333-342 (10 pages)
온톨로지는 시맨틱 웹을 구현하기 위해 중요한 역할을 하지만 이를 구축하는 작업은 많은 시간을 필요로 한다. 그러므로 기존 웹의 데이터 중 많은 양을 차지하고 있는 관계형 데이터베이스로부터 온톨로지를 자동으로 생성하는 연구들이 진행되고 있다. 기존의 연구들은 데이터베이스 스키마와 저장된 데이터 분석을 통한 온톨로지 생성에 대한 연구들이 주를 이룬다. 이러한 연구들은 데이터베이스 스키마 중 테이블과 제약조건만을 분석하여 온톨로지 스키마를 생성하며, 뷰 정의를 고려하지 않는다. 그러나 뷰는 데이터베이스... -
워드넷의 의미 관계 집합을 이용한 온톨로지 매핑
곽정애, 용환승, Kwak. Jung-Ae, Yong. Hwan-Seung 한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 10 Pages
한국정보과학회 정보과학회논문지. Journal of KIISE. 데이타베이스 2009, Vol.36 No.6 466-475 (10 pages)
다양한 온톨로지 개발로 온톨로지간에 정보공유와 재사용이 필요하게 되면서 온톨로지 매핑에 관련된 연구가 활발이 이루어지고 있다. 온톨로지 매핑 기법으로는 어휘 유사성, 구조 유사성, 인스턴스 유사성, 추론 유사성 검사 기법으로 나누어진다. 이 중 어휘 유사성 검사 기법은 대부분의 온톨로지 매핑 연구에서 사용하는 기법으로써 주로 워드넷에 정의되어 있는 동의어 집합만을 사용한다. 이에 본 연구에서는 워드넷에 정의되어 있는 동의어 집합 외에 상위어, 하위어, 전체어, 부분어 집합의 모든 단어들을 포함한 수퍼워드셋을...
