효소적 및 화학적 분해법으로 Pseudomonas putida의 5S rRNA의 결합순서를 결정하였다. P. putida의 5S rRNA는 120개의 누클레오티드로 된 사슬 길이이었다. 이 RNA에는 변형된 누클레오시드가 하나도 없다. P. putida, P. aeruginosa, 및 P. fluorescens 들의 5S rRNA들 사이의 상동성은 전체길이의 85% 이상이다. 핵산가수분해효소 S1과 RNase T1으로 처리한 실험결과에 기초하여 5S rRNA의 가능한 이차구조를 만들어 보았다. 이 이차구조에는 불안정한 나사선 부분이 두 군데 있으며 몇 군데에서는 비표준형 A G 염기쌍이 있음을 알았다.
We have determined the sequence of 5S rRNA of Pseudomonas putida by enzymatic and chemical degradation methods. P. putida 5S rRNA has a chain length of 120 nucleotides. It contains no modified nucleoside. Homologies among 5S rRNAs of P. putida, P. aeruginosa, and P. fluorescens are higher than 85% of the total sequence. Based on the information from nuclease S1 and RNase T1 treatment, a possible secondary structure of 5S rRNA has been constructed. We have found two unstable helix regions and nonstandard A G base pairs at several points.
