파아지 T7 게놈의 유전자 10의 앞부분에는 파아지 RNA 중합효소에 의한 전사와 숙주 대장균 리보솜에 의한 번역에 필요한 염기열들이 있다. 이 부위의 DNA가 휘어져 있는지를 살펴보았다. 우선 각 부위의 DNA 조각이 나란히 중복된 플라스미드를 제조하여 여러 가지 제한효소로 절단하였을 때 서로 다른 위치에서 시작하지만 같은 조성과 길이를 가진 조각들이 얻어질 수 있도록 하였다. 이들을 폴리아크릴아미드 겔 전기영동으로 분석한 결과 번역개시 코돈인 ATG 아래로 30 염기쌍 떨어진 곳에서 DNA가 휘어져 있음을 알 수 있었다. 이 주위에는 DNA를 휘게 하는 아데닌 소중합 염기열이 없기 때문에, 연접 염기쌍 사이의 횡전 벚 경사 쐐기 각도들을 이용하여 전체 DNA의 휘어진 정도를 계산한 결과, 겔상의 이동 속도 변화와 잘 일치하였다. 이 결과는 DNA가 각 인접 염기쌍 사이의 횡전과 경사에 의해서 휘어진다는 설을 뒷받침하고 있다.
Just upstream of the gene 10 in bacteriophage T7 genome there exist expression regulatory sequences for phage T7 RNA polymerase transcription and hose E. coli ribosome translation. These DNA regions have been examined for sequence-directed DNA bending. First, plasmids containing a tandem repeat of each were constructed. Then, each plasmid was digested with various restriction enzymes to produce circularly permuting DNA fragments of the same length. Our results of polyacrylamide gel electrophoresis of the fragments revealed that about 30 base pairs downstream of the translation initiation codon ATG there appears to exist a sequence-directed DNA bending. The bent region does not contain any oligo(A) tract which is known to cause bending of DNA. Calculations of the accumulated DNA axis deflection angles of DNA fragments based on the roll and tilt wedge angles of nearest neighbor base pairs revealed a good correlation between the experimental gel mobility retardation degrees and calculated DNA axis deflection angles of all the permuted DNA fragments. These data support the wedge model of DNA curvature.
