2단계 발효를 거쳐 생산된 4종의 과일 식초에 대한 이화학적 특성을 비교한 결과, 산도는 포도 식초에서 높았고, 유리당 함량은 매실 식초에서 가장 높았다. 또한 과일 식초의 종류에 따라 유기산 조성 비율에 현저한 차이를 나타내어, 원료 과일의 특성을 확인할 수 있었다 매실 식초의 경우 citric acid, 사과 식초는 malic acid, 감 식초는 galacturonic acid, 포도식초는 tartaric acid의 비율이 높았다. 총 유리아미노산 함량은 사과 식초에서 현저히 높았고, 감 식초, 포도 식초, 매실 식초는 유사한 수준이었다.