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siRNAs Derived from Cymbidium Mosaic Virus and Odontoglossum Ringspot Virus Down-modulated the Expression Levels of Endogenous Genes in Phalaenopsis equestris
Han-hong Lan, Cui-mei Wang, Shuang-shuang Chen, Jian-ying Zheng 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 13 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2019, 35권 5호 11 508-520 (13 pages)
Interplay between Cymbidium mosaic virus (CymMV)/ Odontoglossum ringspot virus (ORSV) and its host plant Phalaenopsis equestris remain largely unknown, which led to deficiency of effective measures to control disease of P. equestris caused by infecting viruses. In this study, for the first time, we characterized viral small interfering RNAs (vsiRNAs) profiles in P. equestris co-infected with CymMV and ORSV through small RNA sequencing technology. CymMV and ORSV small interfering RNAs (siRNAs)... -
Genome-Wide Analysis of Type VI System Clusters and Effectors in Burkholderia Species
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 12 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2018, 34권 1호 2 11-22 (12 pages)
Type VI secretion system (T6SS) has been discovered in a variety of gram-negative bacteria as a versatile weapon to stimulate the killing of eukaryotic cells or prokaryotic competitors. Type VI secretion effectors (T6SEs) are well known as key virulence factors for important pathogenic bacteria. In many Burkholderia species, T6SS has evolved as the most complicated secretion pathway with distinguished types to translocate diverse T6SEs, suggesting their essential roles in this genus. Here we... -
Characterization of the Rosellinia necatrix Transcriptome and Genes Related to Pathogenesis by Single-Molecule mRNA Sequencing
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 8 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2017, 33권 4호 2 362-369 (8 pages)
White root rot disease, caused by the pathogen Rosellinia necatrix, is one of the world’s most devastating plant fungal diseases and affects several commercially important species of fruit trees and crops. Recent global outbreaks of R. necatrix and advances in molecular techniques have both increased interest in this pathogen. However, the lack of information regarding the genomic structure and transcriptome of R. necatrix has been a barrier to the progress of functional genomic research... -
Profiling of Disease-Related Metabolites in Grapevine Internode Tissues Infected with Agrobacterium vitis
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 11 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2016, 32권 6호 1 489-499 (11 pages)
Green shoot cuttings of 10 different grapevine species were inoculated with Agrobacterium vitis to find disease-related metabolites in the grapevine. Crown galls formed 60 days after inoculation varied in gall severity (GS) evaluated by gall incidence (GI) and gall diameter (GD), which were classified into three response types as RR (low GI and small GD), SR (high GI and small GD), and SS (high GI and large GD), corresponding to resistant, moderately resistant, and susceptible responses,... -
The Effects of Joint Reference and Mutual Exclusivity on the Application of Whole-Object Assumption in 3-Year Olds Filipino-English Bilingual Preschool Students
Edna S. Miraflores, Rochelle Irene G. Lucas 환태평양유아교육연구학회 Asia-Pacific journal of research in early childhood education 19 Pages
환태평양유아교육연구학회 Asia-Pacific journal of research in early childhood education 2015, Vol.9 No.1 5 91-109 (19 pages)
This study investigated the word learning constraints 3-year old pre-school students resort to in learning a new word or label. The study tested three possible constraints specifically, the Whole Object Assumption to determine if it plays a primary role in the learning of a new word/label in young children, the Mutual Exclusivity Principle and the Joint Reference Principle to determine if these override the Whole Object Assumption in word learning. Each constraint was tested through audio-visual... -
Designing Researcher Information Retrieval Interface based on Ontological Analysis
서은경, 박미향, Seo. Eun-Gyoung, Park. Mi-Hyang 한국정보관리학회 정보관리학회지 22 Pages
한국정보관리학회 정보관리학회지 2009, Vol.26 No.2 173-194 (22 pages)
최근 특정 도메인의 개념에 대한 정확한 정의, 계층적 관계나 추론규칙을 정형화된 어휘로 기술된 온톨로지 지식을 기반하는 시맨틱 탐색기법이 정보검색시스템에 응용됨에 따라 이용자는 보다 쉽게 지식기반을 항해할 수 있다. 본 연구의 목적은 의미적 애매성을 줄여주고, 의미적 관계성을 제시해 줌으로서 이용자가 보다 정확하고 쉽게 정보를 검색할 수 있게 해주는 온톨로지 기반의 정보검색 인터페이스를 개발하는 것이다. 이를 위해서 본 연구는 연구자정보 기술요소들의 클래스의 계층관계, 데이터의 계층관계 및 속성, 관계... -
Proteomic Changes in the Sound Vibration-Treated Arabidopsis thaliana Facilitates Defense Response during Botrytis cinerea Infection
Ritesh Ghosh, Bosung Choi, Young Sang Kwon, Tufail Bashir, Dong-Won Bae, Hanhong Bae 한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 14 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2019, 35권 6호 7 609-622 (14 pages)
Sound vibration (SV) treatment can trigger various molecular and physiological changes in plants. Previously, we showed that pre-exposure of Arabidopsis plants to SV boosts its defense response against Botrytis cinerea fungus. The present study was aimed to investigate the changes in the proteome states in the SV-treated Arabidopsis during disease progression. Proteomics analysis identified several upregulated proteins in the SVinfected plants (i.e., SV-treated plants carrying Botrytis... -
Microarray Analysis of Gene Expression Profiles in Response to Treatment with Melatonin in Lipopolysaccharide Activated RAW 264.7 Cells
JuYeonBan, BumSikKim, SooCheolKim, DongHwanKim, Joo-HoChung 대한생리학회-대한약리학회 The Korean Journal of Physiology & Pharmacology 8 Pages
대한생리학회-대한약리학회 The Korean Journal of Physiology & Pharmacology 2011, Vol.15 No.1 4 23-30 (8 pages)
Melatonin, which is the main product of the pineal gland, has well documented antioxidant and immune-modulatory effects. Macrophages produce molecules that are known to play roles in inflammatory responses. We conducted microarray analysis to evaluate the global gene expression profiles in response to treatment with melatonin in lipopolysaccharide (LPS) activated RAW 264.7 macrophage cells. In addition, eight genes were subjected to real-time reverse transcription polymerase chain reaction... -
고도화된 인간행동 시뮬레이션을 위한 건축정보 기반 온톨로지 활용기술 개발에 관한 연구
유정현(Jeong-Hyun Yu), 이윤길(Yun-Gil Lee) 인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 8 Pages
인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 2018, 제 8권 제 10호 38 397-404 (8 pages)
본 연구는 보다 지능적인 인간행동 시뮬레이션 기술을 개발하기 위하여 진행되었다. 이를 위하여 본 연구에서는 온톨로지와 이의 추론을 통한 기술을 가상공간에 적용하는 방식을 사용하였다. 또한 이와 같은 기술이 설계과정과 보다 유기적으로 연계되어 활용될 수 있도록 하기위하여 상용 설계저작도구를 활용하였다. 즉, BIM(Building Information Modeling) 저작도구로부터 생성된 건물 모델에서 필요한 건축정보를 추출하고 이를 온톨로지 형태(OWL)의 파일로 전환하고 사람형상의 에이전트(Agent)를 기반으로 하는 가상공간에... -
인체자원은행의 효율적인 운영을 위한 OWL 기반의 데이터베이스 구축에 관한 연구
이상민, 김화선, 조훈 인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 10 Pages
인문사회과학기술융합학회 예술인문사회융합멀티미디어논문지 2015, 제 5권 제 3호 7 55-64 (10 pages)
본 연구에서는 인체자원은행의 효율적인 운영과 인체자원은행간의 상호호환을 위해 온톨로지 기반 의 데이터베이스를 구축하였다. 본 연구팀은 선행연구에서 7,197,252개의 인체자원정보를 수집하여 고 품질 인체자원정보 데이터베이스를 구축하였다. 이 과정에서 1,796개의 임상항목을 분류하고 명확한 용어표현을 위해 국제표준용어체계인 SNOMED-CT와 매핑하였다. 그 결과 동일한 국제표준코드에 대 해 서로 다른 용어 및 값 유형, 자료 형을 가지는 826개의 유의어를 발견하였다. 본 연구에서는 유의 어로 인한 중복을 최소화하기...
