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Cloning of the 5`-end and Amplification of Full-Length Cdna of Genomic RNA of Lily symptomless virus
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 5 Pages
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal 2002, 18권 4호 3 187-191 (5 pages)
DNA band about 600 bp harboring the 5`-end of genomic RNA of the virus was successfully amplified by reverse transcription- polymerase chain reaction (RT-PCR) and rapid amplification of cDNA ends (RACE), and was cloned for nucleotide sequence determination. Sequence analysis of selected RACE cDNA clones revealed that the LSV 5` non-translated region consists of 67 nucleotides long of AT rich stretch followed GC rich from the 5`-end. To produce full-length cDNA products for the viral genomic RNA,... -
Analysis of Gene Expression in Benzo[a]pyrene-exposed Sebastes schlegeli using Differential Display Polymerase Chain Reaction
염승식, 우선옥, 최은석, 김소정, 오로라, 이석찬, 이택견, Yum. Seungshic, Woo. Seonock, Choi. Eunseok, Kim. Sojung, Oh. Rora, Lee. Sukchan, Lee. Taek Kyun 환경독성보건학회 환경독성학회지 7 Pages
환경독성보건학회 환경독성학회지 2005, Vol.20 No.1 67-73 (7 pages)
반응하는 조피볼락 유전자들의 발굴을 목적으로 진행되었다. 간조직에서 추출한 RNA로부터 벤조피렌의 노출에 의해 발현 양이 달라진 12개의 클론을 발굴하였고, 그 염기서 열을 분석하였다. 또한 벤조피렌의 노출시간을 각각 6, 12, 24시간으로 달리한 조피볼락에서 12개의 클론 중 4개의 클론에 대해 northern blot 분석이 실시되었으며, 이들 모두 노출시간에 따 라 발현양이 증가 또는 감소하는 것이 확인되었다. 본 연구결과는 오염물질의 영향에 의한 유전자들의 발현에 관한 전반적인 지식을 제공하였고, 나아가 환경오염이나 외부... -
흑조위축병 바이러스 RNA를 절단하는 망치머리형 라이보자임의 제작
김주곤, 손성한, 이석순, 황영수, 박종석, Kim. Ju-Kon, Sohn. Seong-Han, Lee. Sug-Soon, Hwang. Young-Soo, Park. Jong-Sug 한국응용생명화학회 한국농화학회지 6 Pages
한국응용생명화학회 한국농화학회지 1995, Vol.38 No.6 522-527 (6 pages)
oligonucleotides는 DNA 합성기로 합성 후 서로 합치고, pBluescript KS(+)에 삽입하였다. 라이보자임과 기질 RNA는 $T_3$ RNA polymerase로 기내 전사하여 각각 193과 183 nucleotide의 RNA를 얻었다. 기질 RNA는 라이보자임 RNA에 의해 $55^{circ}C$에서 2개의 조각으로 절단되었으나 $37^{circ}C$에서는 절단되지 않았다. 또한 RBSDV의 3번 조각 RNA도 동일한 라이보자임에 의해 절단되었다. 이러한 결과로 합성된 헤머해드 라이보자임은 기내 절단 능력을 가지며 형질전환 식물체에서 antiviral agent로 이용될 수 있을 것이다. -
Polymerase Chain Reaction 방법에 의한 Halobacteria gvp 유전자의 역전사 및 증폭
윤병수, 이상섭 한국미생물학회 미생물학회지 4 Pages
한국미생물학회 미생물학회지 1992, Vol.30 No.6 456-459 (4 pages)
가스포 형성에 관여하는 유전자로, 이들은 그 transcripts 의 분석에 있어 특유의 연약성 때문에 많은 실험상의 문제를 야기시키고 있다. 본 실험은 연약한 mRNA 를 reverse transcriptase 를 사용, DNA 로 바꾸고 이를 다시 PCR(Polymerase Chain Reaction) 방법으로 증폭시킴으로써, 유전자의 연약한 mRNA 를 다시 상보적인 안정한 DNA 로 대치케 하여 RNA 상의 cloning, RNA sequencing 을 용이하게 하였다. 결과는 유전자 gvpD 에서 거의 전 ORF(Open Reading Frame) 의 범위에서 northern hybridization 에서 발견치 못한 transcipts... -
Examination of Parameters Affecting Polymerase Chain Reaction in Studying RAPD
윤철식, Yoon. Cheol-Sik 한국균학회 한국균학회지 9 Pages
한국균학회 한국균학회지 1992, Vol.20 No.4 315-323 (9 pages)
하였다. 그 결과 약 15 ng의 DNA가 효과적인 PCR에 적합한 양이었으며 PCR에 사용되는 성분(reaction component)들의 농도가 PCR 결과에 있어서 상호의존관계에 있었고 DNA 용액에 포함되어 있는 RNA가 DNA 증폭을 방해하는 작용을 하였다. $25;{mu}l$의 PCR 반응용액에 30ng의 10-mer primer, $200;{mu}M$ dNTP, 0.001% gelatin, 1.5 mM $MgCl_2$, 10 mM Tris-Cl(pH 8.8), 50 mM KCl, 0.1%, Triton X-100, 2units의 Taq DNA polymerase, 그리고 RNA를 제거한 15 ng의 DNA를 사용한 결과 가장 재현성있는 RAPD marker들이 증폭되었다. -
파아지 SP6 RNA 중합효소의 전사 개시위치 선정에 대한 돌연변이적 분석
남상철, 강창원, Nam. Sang-Chul, Kang. Chang-Won 생화학분자생물학회 한국생화학회지 7 Pages
생화학분자생물학회 한국생화학회지 1988, Vol.21 No.3 312-318 (7 pages)
염기 특이적인 멈춤에 의하여 전사가 중단된 RNA들의 정확한 크기를 재어 각 돌연변이의 전사 개시 위치를 결정하였다. -4부터 -1 위치의 TATA 염기열을 포함하는 전사촉진제 윗 부분의 염기서열은 바뀌지 않고 +1 G가 C 또는 A로 바뀌었을때, 전사 개시는 아랫 부분의 염기 서열에 관계없이 여전히 +1 위치에서만 이루어졌다. 그러므로, 파아지 SP6 RNA 중합효소는 직접 결합하는 전사촉진제 윗 부분으로부터 정확히 일정한 거리에 있는 위치에서 첫 누클레오티드의 종류에 관계없이 전사를 개시한다고 여겨진다. 그러나, -4로부터 +1... -
파아지 SP6 RNA 중합효소에 의한 전사의 연속성
남상철, 강창원, Nam. Sang-Chul, Kang. Chang-Won 생화학분자생물학회 한국생화학회지 6 Pages
생화학분자생물학회 한국생화학회지 1988, Vol.21 No.3 306-311 (6 pages)
반응에서 파아지 SP6 RNA 중합 효소는 그 제한된 누클레오티드의 위치에서만 특이적으로 멈추어 전사 연장 복합체가 해리된다. 이들 RNA로 구성된 sequencing ladder를 고해상도의 polyacrylamide-urea겔 전기영동을 통하여 얻었다. 또한, 6개 염기 길이까지의 RNA들은 염기 특이적으로 뿐만 아니라 비특이적으로도 합성되었다. 이 결과로부터 파아지 SP6 RNA 중합효소는 6개 염기 길이까지의 RNA를 합성한 후 개시중단 순환 (abortive initiation cycling) 과정을 벗어나 7개 염기길이의 RNA를 합성하면서 안정한 전사 연장 과정으로... -
K11 RNA 중합효소의 Cloning 및 발현
이상수, Lee. Sang-Soo 배재대학교 자연과학연구소 自然 科學 論文集 : 배재대학 첨단과학연구소 6 Pages
배재대학교 자연과학연구소 自然 科學 論文集 : 배재대학 첨단과학연구소 1997, Vol.9 No.1 19-24 (6 pages)
중합효소로 다른 T7 그룹phage RNA 중합효소와 많은 상동성을 보인다. (대장균 phage T7, T3과 Salmonella tyhimurium phage SP6 RNA 중합효소). 이미 우리는 T7과 SP6 전사촉진제 변이체를 제조한 바 있고 T7과 SP6 RNA 중합효소의 전사촉진제 특이성을 연구한 바 있다 (이상수와 강창원, 1993). K11 RNA 중합효소의 전사촉진제 특이성을 알아보기 위해 SP6 전사촉진제 변이체를 사용하여 in vitro K11 RNA 중합효소의 활성을 측정하였다. 이 변이체 중 K11 전사촉진제와 가장 유사한 것이 가장 높은 K11 RNA 중합효소 활성을 보였다.
